發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：江蘇
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Perl語(yǔ)言是生信學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)需要。
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Perl語(yǔ)言編程
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生信相關(guān)的perl知識(shí)收集
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記錄學(xué)習(xí)的代碼
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@王雪琴_e546 分開(kāi)做
系統(tǒng)發(fā)育比較分析—R
系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)是研究物種進(jìn)化歷史必不可少的信息，我們可以利用它得到一些重要?dú)v史線索，如： 生物多樣性（物種形成或滅絕）； 物種性狀進(jìn)化與多樣化（Character evoluti...
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「基因組」基因共線性可視化（待更新）軟件 1.JCVI2.NGenomeSyn3.synvisio在線工具：鏈接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.git...
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genblastg和genewise鑒定缺失基因
基于組裝好的基因組，例如某一個(gè)基因在該基因組中無(wú)注釋，需檢查是否為注釋錯(cuò)誤，還是該基因本身缺失。 軟件：genblastg和genewise genblastg下載地址：ht...
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接上，pcoc檢測(cè)氨基酸性質(zhì)的趨同
pcoc檢測(cè) step1. 處理樹(shù)文件；將第2步生成的02_Trees文件夾拷貝到當(dāng)前目錄，并修改為.txt結(jié)尾 step2：處理序列文件 step3: 準(zhǔn)備需要檢測(cè)物種的文...
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野生動(dòng)物調(diào)查方法
主要步驟 1. 確定調(diào)查目標(biāo) 調(diào)查什么動(dòng)物（魚類、兩棲爬行動(dòng)物、鳥(niǎo)類或哺乳動(dòng)物） 調(diào)查動(dòng)物什么（多樣性、種群數(shù)量、棲息地） 調(diào)查范圍時(shí)多大（全國(guó)、全省、保護(hù)區(qū)） 采用什么方法...
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僅作個(gè)人筆記 - 基于fithic的輸出結(jié)果統(tǒng)計(jì)染色體體間顯著互作的密度-1.更新于2025.4借助于GPT，這個(gè)功能一下子就可以實(shí)現(xiàn)，下面展示GPT的成果輸出文件可以直接用pheatmap畫圖 cat interact_density_to_m...
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WGDI - 推斷祖先核型0.僅作個(gè)人筆記使用意思就是只考慮我能不能看懂具體每個(gè)參數(shù)的含義參照官方文檔, 這里全部用默認(rèn)參數(shù)https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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ChromoSSE: 染色體數(shù)目進(jìn)化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.輸入文件的準(zhǔn)備.兩個(gè)文件, 一個(gè)是進(jìn)...
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2023-09-21 PSMC可以評(píng)估有效群體大小的原因
介紹這個(gè)軟件的概念前，我需要先解釋一個(gè)概念最近共同祖先時(shí)間（the time since the most recent common ancestor，TMRCA）。當(dāng)我們...
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隨筆 | 十年之后，我們?nèi)匀粵](méi)能坐在一起喝上一口啤酒時(shí)間過(guò)得很快，或許可以說(shuō)，從7月底到現(xiàn)在，我仍然沒(méi)有忙完手頭的事情。上午收到消息時(shí)，我仍然在趕著項(xiàng)目，有時(shí)候，不知道是對(duì)是錯(cuò)。多算一年半年，與基友「醬油」認(rèn)識(shí)可能也是10年。...
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