IP屬地：廣東
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2025-12-01
1.基本邏輯是利用orthofinder進行全基因組水平家族基因鑒定（cafe5需要的輸入文件1，需要格式轉(zhuǎn)化）和物種進化樹分析； 2.基于or...
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2025-11-24從fasta和gff文件中提取gDNA
1.從gff2bed awk'$3=="gene" {print $1 "\t" $4-1 "\t" $5 "\t" $9 "\t0\t" $7...
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2025-08-26提取最長轉(zhuǎn)錄本2
1.先提取最長轉(zhuǎn)錄本gff（conda install -c bioconda agat -y） perl ~/miniconda3/bin/a...
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2025-07-1學習vg使用1. 序列比對到圖基因組 vg map -m short -t 24 -x graph.xg -g graph.gcsa -f Sample40...
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2025-07-04obsutil 下載華為云數(shù)據(jù)
下載文件夾： /public/home/kongweilong/Biosofts/obsutil/obsutil share-cp https:...
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2025-07-02提取轉(zhuǎn)錄本CDS、UTR序列
http://www.itdecent.cn/p/d1d8d59f61fe
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2025-04-11GWAS顯著位點選擇
確定閾值分為了不同的流派。 第一種方法，Bonferroni矯正 這種方法應(yīng)用最多，一般是N表示參與分析的SNP的個數(shù)，閾值可以是： * 1/N...
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2024-09-27通過擬合線性回歸模型lm()實現(xiàn)代謝組數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的簡單關(guān)聯(lián)
1. 代謝組數(shù)據(jù)示例（test_meta.txt） SampleID mws1401 A13 0.00 A16 0.00 A7 0.00 A17...
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2024-08-07 從bam文件中calling特定基因區(qū)段的SNP變異
gatk --java-options "-Xmx185g -Djava.io.tmpdir=./tmp" HaplotypeCaller -R...