hello，大家好，隨著分析的深入，PCA和NMF分析的"斗爭"也越來越激烈，是時(shí)候帶領(lǐng)大家來真正認(rèn)識(shí)一下PCA和NMF的區(qū)別了。 方法背景 隨著硬件技術(shù)的發(fā)展，每年被記錄和...
IP屬地：陜西
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)分析之主成分分析（PCA）與因子分析（NMF） -
CIBERSORT 免疫浸潤(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸潤計(jì)算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介紹CIBERSORT。 1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly...
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學(xué)習(xí)小組Day7-碧海琴天測(cè)序知識(shí) 一代測(cè)序 Sanger測(cè)序是最早的測(cè)序方法，也就是雙脫氧終止反應(yīng)法。其基本原理就是利用雙脫氧的核苷酸不帶有羥基的特性，因此后續(xù)的核苷酸不能夠繼續(xù)結(jié)合上去，然后DNA...
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學(xué)習(xí)小組Day6-碧海琴天
Conda的下載和安裝 今天的學(xué)習(xí)主要是學(xué)習(xí)了linux系統(tǒng)中conda的下載和安裝。 conda是什么呢？conda其實(shí)就相當(dāng)于是linux系統(tǒng)中的應(yīng)用商店，和我們手機(jī)里面...
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學(xué)習(xí)小組Day5-碧海琴天初識(shí)Linux系統(tǒng) 早就聽聞Linux系統(tǒng)的大名，因?yàn)榇蠹叶荚谡f如果要做生信的話，R和Linux系統(tǒng)是基礎(chǔ)，但是我卻一直找不到方法踏入這扇門。今天就跟著生信星球，跟著花花和豆...
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學(xué)習(xí)小組Day4-碧海琴天安裝和加載R包 鏡像設(shè)置 初級(jí)模式 首先就可以在菜單欄當(dāng)中設(shè)置鏡像，在菜單欄上選擇Tools>global options，然后按照下面的方法設(shè)置就可以了 缺點(diǎn)：這種方法雖然...
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學(xué)習(xí)小組Day3-碧海琴天
一些重要提示# （1）R的賦值符號(hào)不是等號(hào)，而是<-（但是在一本書上看到的貌似也可以用等號(hào)）（2）在Console 控制臺(tái)輸入命令，相當(dāng)于Linux的命令行（3）R的代碼都是...
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學(xué)習(xí)小組Day2-碧海琴天R語言學(xué)習(xí)—Day1 作圖部分 今天跟著生信星球的課程開始了R語言的學(xué)習(xí)，因?yàn)橹熬陀邢螺d過R和R studio，所以在下載部分就沒有花很多的時(shí)間。一直都聽說R是一個(gè)作圖非常...
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學(xué)習(xí)小組Day1-碧海琴天開始學(xué)習(xí)生信啦 第一天就從平臺(tái)學(xué)習(xí)開始 今天電腦里面又下載了好多超級(jí)實(shí)用的小軟件，比如說文件查找軟件everthing，截圖工具snipaste等，這些工具今后肯定為我這個(gè)電...