發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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Short reads aligners-Thelearningnotesofthebiostarhandbook(8)map與alignment 新一代測(cè)序數(shù)據(jù)的處理過(guò)程中，map/alignment總是同時(shí)出現(xiàn)，那么二者的區(qū)別是什么呢？大致上可以這樣理解：ma...
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BLAST-The?learning?notes?of?the?biostar?handbook(7)Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) 個(gè)用來(lái)比對(duì)生物序列的一級(jí)結(jié)構(gòu)(如不同蛋白質(zhì)的氨基酸序列或不同...
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k-mers和序列比對(duì)The?learning?notes?of?the?biostar?handbook(6)k-mers k-mers是指將序列分為k個(gè)堿基的字符串，一般長(zhǎng)短為m的序列可以分成m-k+1個(gè)k-mers。ATGCA的所有k-mer如下：2...
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常見(jiàn)的數(shù)據(jù)格式及數(shù)據(jù)庫(kù)The learning notes of the biostar handbook(4)常見(jiàn)的數(shù)據(jù)格式 genbank genbank是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院維護(hù)的基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)，匯集并注釋了所有公開(kāi)的核酸以及蛋白質(zhì)序列。每個(gè)記錄代表了...
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基因本體論The learning notes of the biostar handbook(3)gene ontology 在早兩個(gè)月前，按照班長(zhǎng)的RNAseq教程，把整個(gè)流程模仿了一遍，最終得出很多差異表達(dá)的基因，可是這些基因（基因產(chǎn)物）...
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Linux常用的命令及初窺正則表達(dá)式--The learning notes of the biostar handbook(2)
Linux常用的命令 目錄操作命令 ls 顯示目錄文件 ls -al-a 顯示所有文件，包括.及..-l 詳細(xì)信息-d 顯示目錄本身的信息，而不...
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生物學(xué)基礎(chǔ)及環(huán)境準(zhǔn)備--The learning notes of the biostar handbook(1)
萬(wàn)事開(kāi)頭難，從前都是碎片化的學(xué)習(xí)生信，一些基本的概念還是能粗略的理解，但知識(shí)始終無(wú)法結(jié)構(gòu)化，更別說(shuō)在公開(kāi)的場(chǎng)合寫(xiě)下文字記錄自己的學(xué)習(xí)心得。這次在...
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遇見(jiàn)生信
第一次接觸到生物信息學(xué)可以追溯到讀研究生那會(huì)。當(dāng)時(shí)室友發(fā)表了一篇文章，大致內(nèi)容是從GEO下載正常男性與不育男性精子的芯片數(shù)據(jù)，然后通過(guò)BRB_a...