為什么您assoc后，有A2呢？
GWAS分析-說人話（9）初嘗關(guān)聯(lián)分析禁果前言 OK，這里只是初嘗關(guān)聯(lián)分析，有很多參數(shù)上的設(shè)置，及說明 請(qǐng)參考其他文章（有空會(huì)在最下面補(bǔ)上）。 書接上一回（GWAS分析-說人話（4）合并數(shù)據(jù)），當(dāng)我們整理好了一個(gè)合并...
IP屬地：臺(tái)灣
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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我想做個(gè)理想主義者昨天（6.17）是一年一度的生日。一如既往，要進(jìn)行一番自我思考、自我剖析。 緣分妙不可言 本科畢業(yè)4年，碩士畢業(yè)1年，9月即將正式入學(xué)讀生物博士。8年前，高考結(jié)束的那一刻，我...
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您好，想問一下，我在vcf轉(zhuǎn)換成map,ped文件時(shí)候，報(bào)錯(cuò)，line 23969 of .vcf file has fewer tokens than expected， 您遇到過嗎，2號(hào)染色體，轉(zhuǎn)不下去了
基因型數(shù)據(jù)與1000G merge后做PCA看人群分布
寫在前面，對(duì)于生信新手來說，不熟悉代碼的基礎(chǔ)，總是空中樓閣一般，想搜一條代碼、做一些適合自己數(shù)據(jù)的運(yùn)算更是難上加難，踩過的坑總要填，為了新手們不要像我一樣浪費(fèi)時(shí)間在這苦惱的代...
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基因型數(shù)據(jù)與1000G merge后做PCA看人群分布
寫在前面，對(duì)于生信新手來說，不熟悉代碼的基礎(chǔ)，總是空中樓閣一般，想搜一條代碼、做一些適合自己數(shù)據(jù)的運(yùn)算更是難上加難，踩過的坑總要填，為了新手們不要像我一樣浪費(fèi)時(shí)間在這苦惱的代...
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一顧傾人城， 再顧傾人國(guó)
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UKBB數(shù)據(jù)集下載流程（第二節(jié)）很久沒有更新，被老板抓走做別的去了。 主要數(shù)據(jù)集下載 閱讀使用手冊(cè)上，會(huì)有一些field，bulk, individuals這樣的詞，比較難以對(duì)應(yīng)網(wǎng)站上的標(biāo)簽。下面我來講解一...
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我沒有用過網(wǎng)頁版的，是不是國(guó)內(nèi)不能啊？
TwoSampleMR 遇到的坑
第一次嘗試醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)常用的MR，我選擇了比較多用的R包，TwoSampleMR, 這個(gè)包還有一個(gè)webApp -- MRbase.所有流程基本和網(wǎng)上可以搜到的一樣，這里推薦這個(gè)...
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想問下作者，GUI生成的熱圖什么的怎么保存呢？
02—甲基化芯片的一般分析流程
什么是甲基化芯片？一文了解 MethylationEPIC 850K 甲基化芯片 簡(jiǎn)而言之，是基于亞硫酸鹽處理后的DNA序列雜交的信號(hào)探測(cè)。亞硫酸鹽是甲基化探測(cè)的：金標(biāo)準(zhǔn)“，...
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您好，想問一下您用這個(gè)跑過EPIC的數(shù)據(jù)嗎
ChAMP包學(xué)習(xí)(4)
9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息學(xué)研究的重要環(huán)節(jié)。在前面的步驟之后，已經(jīng)獲得了一些重要的DMPs或DMRs，因此我們可...
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ChAMP包學(xué)習(xí)(4)9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息學(xué)研究的重要環(huán)節(jié)。在前面的步驟之后，已經(jīng)獲得了一些重要的DMPs或DMRs，因此我們可...
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努力成為R 極客<br>R和python愛好者<br>bioninfomatics
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GWAS imputationGWAS imputation是什么？ Genotype imputation 是運(yùn)用連鎖不平衡的原理依據(jù)一個(gè)高密度的參考基因組填補(bǔ)要研究數(shù)據(jù)的一種方法。 常用的參考基因組數(shù)...
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畢業(yè)于山東大學(xué)，具有6年生物信息分析工作經(jīng)驗(yàn)，一直從事動(dòng)植物及人的重測(cè)序方向。擅長(zhǎng)群體重測(cè)序及GWAS分析；進(jìn)行過NIPT，CNV，腫瘤ctDNA，遺傳腫瘤等人類健康方向相關(guān)的分析；使用linux，perl，R，git等
