加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測(cè)試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出
IP屬地：廣西壯族自治區(qū)
-
-
芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過(guò)bulk數(shù)據(jù)了，前幾天突然被要求分析一個(gè)文章的數(shù)據(jù)時(shí)有點(diǎn)亂了手腳，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
-
如果表達(dá)矩陣被歸一化會(huì)發(fā)生什么事情起源于，某個(gè)吃了很多漢堡王一起學(xué)習(xí)的日子，技能樹一眾學(xué)徒一起學(xué)習(xí)從GEO數(shù)據(jù)挖掘到limma差異分析等等等。 選的數(shù)據(jù)集倒是很有、趣。隨便畫的熱圖是這樣的??（已經(jīng)很整齊均...
-
富集分析天花板之ClusterProfiler4說(shuō)在前面 在國(guó)內(nèi)做生信的小伙伴或多或少都聽過(guò)一個(gè)大名鼎鼎的名字---Y叔，想當(dāng)初小編初入生信大門時(shí)還專門百度查了一下，他就是南方醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)系主任余光創(chuàng)教授。Y叔在國(guó)際...
-
單細(xì)胞數(shù)據(jù)處理小細(xì)節(jié)匯總1. Seurat對(duì)象查看當(dāng)前的Assay 在進(jìn)行了SCTransform操作后，矩陣默認(rèn)會(huì)變成SCT矩陣，如果不加設(shè)置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
-
-
使用ComplexHeatmap包繪制熱圖加載所需R包 構(gòu)建測(cè)試數(shù)據(jù)集 使用Heatmap函數(shù)繪制熱圖 使用HeatmapAnnotation函數(shù)構(gòu)建注釋對(duì)象 使用add_heatmap函數(shù)組合多個(gè)熱圖或注釋信息 r...
-
R語(yǔ)言參考卡片（二）圖形裝置（Graphics Devices）x11(), windows() 打開一個(gè)繪圖窗口plot.new() 為繪制新圖形結(jié)束當(dāng)前圖形窗口dev.set() 指定圖形窗...
-
R語(yǔ)言可視化（二十七）：序列l(wèi)ogo圖繪制27. 序列l(wèi)ogo圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 使用seqLogo包繪制序列l(wèi)ogo圖 使用ggseqlogo包繪制序列l(wèi)ogo圖 使用motifStack包...
