S?rensen 指數(shù)和 Jaccard 指數(shù)作為配對(duì)樣方間β 多樣性的度量，使用 Baselga 在 2010 和 2012 年提出的 β 多樣性分解方法結(jié)合 Legend...
發(fā)簡(jiǎn)信
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周轉(zhuǎn)（repl）和嵌套（nest）對(duì)β多樣性貢獻(xiàn)的分解
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微生物多樣性qiime2分析流程(13) 數(shù)據(jù)可視化分析(中) 之 繪制pro版PCOA分析圖繪制一個(gè)帶統(tǒng)計(jì)信息花里胡哨的PCOA圖，喜歡的小伙伴可以用以下代碼嘗試
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如何高效的使用chrome瀏覽器如何高效的使用chrome瀏覽器 瀏覽器大概是我們打開(kāi)電腦最常用的應(yīng)用，查找資料、看視頻、在線辦公都離不開(kāi)它。很多時(shí)候我們搜索一個(gè)資料往往要在繁多的廣告中找好久才能找到合適的...
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ggplot2自定義添加P值數(shù)據(jù)分析中通常都需要對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)，仿佛加個(gè)P值就能顯得論文數(shù)據(jù)更加專(zhuān)業(yè)一點(diǎn)，本節(jié)不介紹如何計(jì)算P值，我們來(lái)介紹如何給圖片自定義添加p值 ggsingif來(lái)進(jìn)行一個(gè)統(tǒng)計(jì)檢...
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ggplot2優(yōu)雅的繪制高端熱圖本節(jié)來(lái)介紹如何通過(guò)ggplot2繪制復(fù)雜熱圖 加載R包 加載數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)清洗 繪制熱圖 ggtree繪制聚類(lèi)樹(shù) 繪制樣本分類(lèi)色條 基因長(zhǎng)度信息可視化 基因平均表達(dá)量可視化 展示...
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[R構(gòu)建函數(shù)基礎(chǔ)篇] 計(jì)算多樣性指數(shù)及繪圖本節(jié)來(lái)介紹如何R來(lái)自定義構(gòu)建函數(shù)來(lái)進(jìn)行多樣性指數(shù)計(jì)算及繪圖 加載R包 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 定義函數(shù)計(jì)算多樣性指數(shù) 導(dǎo)出指數(shù)計(jì)算結(jié)果 整理繪圖文件 在此選取我們需要的數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)行展示 定義...
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箱線圖進(jìn)行方差分析并添加顯著性標(biāo)記歡迎關(guān)注R語(yǔ)言數(shù)據(jù)分析指南 本節(jié)來(lái)介紹如何在計(jì)算多樣性指數(shù)的基礎(chǔ)上來(lái)進(jìn)行顯著性標(biāo)記，可在文末找到獲取數(shù)據(jù)的方式 加載R包 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 定義函數(shù)計(jì)算多樣性指數(shù) 數(shù)據(jù)整理 定義顏色...
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利用MicrobiotaProcess完成LEFse分析（近似）對(duì)于Lefse來(lái)說(shuō)，首先測(cè)試所有特征在不同類(lèi)中的值是否存在差異分布。其次，對(duì)顯著不同的特征進(jìn)行事后檢驗(yàn)，不同類(lèi)中子類(lèi)之間的所有兩兩比較應(yīng)都明顯符合類(lèi)趨勢(shì)。最后，利用線性判別分...
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python: 整理Unicycler基因組組裝結(jié)果
導(dǎo)讀 將二代三代Unicycler混合組裝結(jié)果進(jìn)行整理：抽提染色體/質(zhì)粒序列，統(tǒng)計(jì)GC含量，統(tǒng)計(jì)序列長(zhǎng)度，結(jié)構(gòu)。 一、Unicycler結(jié)果 Unicycler二代、三代混合...
