緣起 最近在讀Hilary Glasman-Deal的Science Research Writing, 封面長(zhǎng)下面這樣: [圖片上傳失敗......
背景 原始數(shù)據(jù)下載專(zhuān)題到最后一個(gè)工具啦,前面介紹的很多工具都是下載原始的測(cè)序數(shù)據(jù)的,而這個(gè)則不同,它是NCBI官方推出的用于查詢(xún)和獲取基因、基因...
背景介紹 一句話介紹iSeq:Download sequencing data and metadata from GSA, SRA, ENA,...
背景介紹 今天要介紹的ffq和昨天的gget是同一個(gè)lab出品的,都是加州理工學(xué)院的pachterlab,我研究了一下這個(gè)實(shí)驗(yàn)室的PI,Dr. ...
gget的功能跟之前介紹的fastq-dl不一樣,fastq-dl主要是下載測(cè)序的原始數(shù)據(jù)的,而gget的功能就非常豐富了: 從ensembl下...
萌哥碎碎念 一直以來(lái)都想寫(xiě)一下下載數(shù)據(jù)的這些命令和工具,現(xiàn)在剛好收集了一些,可以寫(xiě)一整個(gè)專(zhuān)題。先分別寫(xiě),也許之后還能出一個(gè)橫評(píng)。目前規(guī)劃的軟件有...
萌哥碎碎念:NCBI的官方注釋流程一直都是出了名的效果拔群準(zhǔn)確度極高,但可惜一直都是非開(kāi)源的,看到這么好用的工具卻用不到自己的項(xiàng)目里,心里可太刺...
工具 使用到的工具是: datasets jq datasets是NCBI官方的工具,可以直接調(diào)用NCBI的API進(jìn)行信息的查詢(xún),返回的結(jié)果是j...
作為一個(gè)十級(jí)互聯(lián)網(wǎng)沖浪選手,當(dāng)看到吳恩達(dá)老師出新課的時(shí)候就已經(jīng)無(wú)腦沖了。 傳送門(mén):https://learn.deeplearning.ai/c...