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Science Research writing 讀書筆記: introduction部分 I
緣起 最近在讀Hilary Glasman-Deal的Science Research Writing, 封面長下面這樣: [圖片上傳失敗......
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原始數(shù)據(jù)下載專題 | datasets——基因與基因組數(shù)據(jù)查詢和獲取的NCBI官方解決方案
背景 原始數(shù)據(jù)下載專題到最后一個工具啦，前面介紹的很多工具都是下載原始的測序數(shù)據(jù)的，而這個則不同，它是NCBI官方推出的用于查詢和獲取基因、基因...
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原始數(shù)據(jù)下載專題 | 用iSeq下載原始測序數(shù)據(jù)
背景介紹 一句話介紹iSeq：Download sequencing data and metadata from GSA, SRA, ENA,...
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原始數(shù)據(jù)下載專題 | 用ffq下載原始測序數(shù)據(jù)
背景介紹 今天要介紹的ffq和昨天的gget是同一個lab出品的，都是加州理工學(xué)院的pachterlab，我研究了一下這個實(shí)驗室的PI，Dr. ...
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原始數(shù)據(jù)下載專題 | gget一個綜合性的生物信息查詢和下載工具
gget的功能跟之前介紹的fastq-dl不一樣，fastq-dl主要是下載測序的原始數(shù)據(jù)的，而gget的功能就非常豐富了： 從ensembl下...
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原始數(shù)據(jù)下載專題 | 用fasq-dl下載fastq數(shù)據(jù)
萌哥碎碎念 一直以來都想寫一下下載數(shù)據(jù)的這些命令和工具，現(xiàn)在剛好收集了一些，可以寫一整個專題。先分別寫，也許之后還能出一個橫評。目前規(guī)劃的軟件有...
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NCBI官方真核生物全基因組注釋流程首次開源！嘗鮮體驗踩坑貼奉上~萌哥碎碎念：NCBI的官方注釋流程一直都是出了名的效果拔群準(zhǔn)確度極高，但可惜一直都是非開源的，看到這么好用的工具卻用不到自己的項目里，心里可太刺...
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datasets使用實(shí)例 | 如何批量獲得特定物種的taxonomy信息？
工具 使用到的工具是： datasets jq datasets是NCBI官方的工具，可以直接調(diào)用NCBI的API進(jìn)行信息的查詢，返回的結(jié)果是j...
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AI Python for Beginners之我見
作為一個十級互聯(lián)網(wǎng)沖浪選手，當(dāng)看到吳恩達(dá)老師出新課的時候就已經(jīng)無腦沖了。 傳送門：https://learn.deeplearning.ai/c...
個人介紹
PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop