本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)，浙大讀博ing。<br>如果沒有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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收藏貼之一 | 寫過熱圖工具的人，給你理清熱圖數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化寫在前面 熱圖，或稱熱力圖，是外文 Heatmap 的直譯。在幾乎所有數(shù)值分析相關(guān)工作中都可以看到。生物信息學(xué)數(shù)據(jù)，自然躲不過。無論是形態(tài)數(shù)據(jù)，還是基因拷貝數(shù)數(shù)據(jù)，或是基因表...
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UniProt蛋白序列批量下載1，人類所有基因蛋白序列下載 數(shù)據(jù)庫地址：https://www.uniprot.org/tool-dashboard[https://www.uniprot.org/too...
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@小小_4dbf 謝謝建議
安裝R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 問題解決
問題 安裝R包（ade4）時(shí)遇到以下問題（缺少庫文件）： 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫（-l 是lib的意思，xxx是庫名） 問題解決： 1...
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@小小_4dbf 謝謝補(bǔ)充
安裝R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 問題解決
問題 安裝R包（ade4）時(shí)遇到以下問題（缺少庫文件）： 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫（-l 是lib的意思，xxx是庫名） 問題解決： 1...
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@jerry_2018 已發(fā)，查收
maftools畫棒棒糖圖 （Lollipop chart）-基因突變可視化
maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語言可視化包，上篇“maftools畫瀑布圖（oncoplot）”(http://www.itdecent.cn/p/6cccf7c4bb0...
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ggplot2幾種常見的散點(diǎn)圖1，散點(diǎn)圖 結(jié)果示例： 輸入文件示例： 代碼： 2，散點(diǎn)圖+擬合曲線+折線圖 結(jié)果示例： 輸入文件示例： 代碼： 3，散點(diǎn)圖+擬合曲線+部分點(diǎn)標(biāo)注 結(jié)果示例： 輸入文件示例：...
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表示p值顯著性。NS:表示不顯著（P>0.05）；*表示P<=0.05;**表示P<=0.01;***表示P<=0.001;****表示P<=0.0001
配對(duì)數(shù)據(jù)wilcox.test檢驗(yàn)及可視化
用途 配對(duì)樣本秩和檢驗(yàn)及可視化（箱線圖） 代碼 加載包 第一組數(shù)據(jù)檢驗(yàn)及畫圖（不單獨(dú)生成圖片） 第2/3/4/5/6組數(shù)據(jù)檢驗(yàn)及畫圖 把多個(gè)圖片組合到一起 方法1： 方法2：...
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獨(dú)立性和一致性檢驗(yàn) chisq 、McNemar‘s、 kappa2 及可視化定義 Pearson's chi squared test： Pearson卡方檢驗(yàn)，由著名統(tǒng)計(jì)學(xué)家Karl Pearson提出，主要是比較兩個(gè)及兩個(gè)以上樣本構(gòu)成比以及兩個(gè)分...
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周運(yùn)來，男，長大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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數(shù)據(jù)過濾-Trimmomatic
為什么要進(jìn)行數(shù)據(jù)過濾 二代測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)堿基識(shí)別得到的原始序列稱為raw-data。raw-data中可能含有接頭（adapter）、低質(zhì)量序列及N序列（N 表示無法確定堿...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是...
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TcellExTRECT 利用全外顯子測(cè)序（WES）評(píng)估腫瘤免疫浸潤程度TcellExTRECT應(yīng)用場(chǎng)景 腫瘤組織的免疫微環(huán)境影響腫瘤進(jìn)化，可以預(yù)測(cè)腫瘤對(duì)于免疫療法的反應(yīng)性以及治療預(yù)后。免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療已經(jīng)成功的應(yīng)用到腫瘤免疫治療中。但大多數(shù)...
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安裝R包 fatal error: zlib.h: No such file or directory 問題解決
問題 安裝R包（seqinr）時(shí)遇到以下問題（缺少config文件）： 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到zlib.h 問題解決： 1，確認(rèn)是否安裝zlib 注：上述命令...
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安裝R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 問題解決
問題 安裝R包（ade4）時(shí)遇到以下問題（缺少庫文件）： 從報(bào)錯(cuò)信息可以看出報(bào)錯(cuò)根本原因是找不到lapack和blas庫（-l 是lib的意思，xxx是庫名） 問題解決： 1...
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@熊歪歪 已發(fā)，查收。
maftools畫棒棒糖圖 （Lollipop chart）-基因突變可視化
maftools是一個(gè)很強(qiáng)大的R語言可視化包，上篇“maftools畫瀑布圖（oncoplot）”(http://www.itdecent.cn/p/6cccf7c4bb0...
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安裝R包時(shí)報(bào)錯(cuò)：Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD else character() :
產(chǎn)生原因 anaconda下安裝的R，R目錄下的/安裝目錄/bin/software/anaconda/lib/R/etc/Makeconf為空 解決版本 1，確定R安裝路徑...
