1. 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 2. 生成距離矩陣， 多個(gè)矩陣的列名及順序必須一致 3. 定義簡單函數(shù) row()和col()函數(shù)用于取矩陣元素的行或列下標(biāo)矩陣。row(as.factor ...
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R語言之將對稱矩陣轉(zhuǎn)為列表 -
基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（下）最近剛返校，事情比較多，每天也很忙，之前寫的《基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（上）》也一直沒來得及更新，缺少cafe輸出結(jié)果的解讀及后面的可視化。最近在簡書上也收到了...
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NGS產(chǎn)品經(jīng)理篇：線上培訓(xùn)業(yè)務(wù)邏輯如今的培訓(xùn)已經(jīng)是NGS業(yè)務(wù)的常態(tài)了，這種常態(tài)還會(huì)持續(xù)一段時(shí)間，不只是因?yàn)檫@是一個(gè)超指數(shù)發(fā)展的行業(yè)，更是因?yàn)槿藗內(nèi)找嬖鲩L的對生命科學(xué)的厚望與單個(gè)團(tuán)體單薄的技術(shù)儲(chǔ)備之間的矛盾。于...
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EffectiveT3 軟件預(yù)測T3SS效應(yīng)蛋白一、主頁 官網(wǎng)：https://effectors.csb.univie.ac.at/method/effectivet3[https://effectors.csb.uni...
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HMMER3.1使用最近在探索全基因組基因家族的分析方法，而找到某一家族需要通過保守結(jié)構(gòu)域來預(yù)測，從而找到物種的某一基因家族，從而進(jìn)行之后的分析。這里就需要用到HMMER3.1軟件，鑒定物種某一...
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我在簡書的第4周年
今天登陸簡書的時(shí)候看到了一個(gè)提示，提醒我已經(jīng)加入簡書4周年了。 不知不覺已經(jīng)寫了將近50多萬的字（不計(jì)代碼），也沒有想到原來我加入簡書正好是五四。 正如當(dāng)我的粉絲數(shù)達(dá)到400...
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R 函數(shù)筆記 | grep()函數(shù)與R語言中的正則表達(dá)式
grep()能對向量中特定條件的元素進(jìn)行查詢，默認(rèn)return為index。grep()語法與grep()大致相似，但默認(rèn)return為logical。 grep() 代碼如...
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R語言常用的數(shù)據(jù)處理的包(2)
這一節(jié)我們來復(fù)習(xí)一下shape2的用法：reshape2包的主要功能函數(shù)是melt（）和cast（），其實(shí)現(xiàn)了長數(shù)據(jù)和寬數(shù)據(jù)之間的轉(zhuǎn)換。 melt的功能 用處：將列名作為行的...
