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    conda activate bowtie2 #bulid bowtie2 index cd /home/yc17628/RefData/hg38_p13 bowtie2-b...

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    單細(xì)胞之富集分析-2:批量GSEA和GSVA分析

    單細(xì)胞富集分析系列: 單細(xì)胞之富集分析-1:?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...

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    單細(xì)胞的GO KEGG GSEA GSVA分析

    今天抽個(gè)空把單細(xì)胞領(lǐng)域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍,跑完以后的感覺(jué)就是有這樣的理解,就是單細(xì)胞我首先會(huì)選擇做GSVA,但是我還會(huì)順便做下kegg或者GSEA...

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    10X空間轉(zhuǎn)錄組-----空間高變基因檢測(cè)之SpatialDE

    今天我們來(lái)學(xué)習(xí)一下簡(jiǎn)單的基礎(chǔ)知識(shí),空間高變基因,之前呢,已經(jīng)分享過(guò)Seurat內(nèi)置的方法計(jì)算高變基因,文章在10X空間轉(zhuǎn)錄組之基因的空間表達(dá)模式[https://www.ji...

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