研究必要性 近年來，高通量技術(shù)極大地推動(dòng)了植物領(lǐng)域的研究進(jìn)程，基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組和代謝組等多個(gè)層面的海量數(shù)據(jù)，能夠進(jìn)一步幫助我們更為全面、系統(tǒng)地解析復(fù)雜的生物變化與調(diào)控過...
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聯(lián)合分析專題--植物篇！--帶你了解多組學(xué)聯(lián)合分析在糧食及經(jīng)濟(jì)作物方向的研究思路 -
處理組裝中的污染序列
通常情況下，我們都不需要考慮組裝中的污染問題。如果我們的樣本經(jīng)過一定清洗，那么測序過程中就很少會(huì)測到目標(biāo)樣本無關(guān)的序列，因此在組裝過程中，這些序列由于信號(hào)過低將不會(huì)被組裝出來...
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一文理清常見的基因富集分析
前言 對(duì)于很多小伙伴來說，剛?cè)胧稚艜r(shí)接觸最多的就是差異分析，即在基因組層面可以算突變率差異，轉(zhuǎn)錄組層面可以算基因表達(dá)水平差異，表觀組可以觀察甲基化水平差異，蛋白質(zhì)組/代謝組...
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生物數(shù)據(jù)庫開發(fā)工具GMOD全家桶GMOD（Generic Model Organism Database） 是專為生物學(xué)家創(chuàng)建的開源項(xiàng)目，生物學(xué)家用作存儲(chǔ)庫和工具的交互應(yīng)用程序和數(shù)據(jù)庫的集合。 連通性是GM...
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一篇數(shù)據(jù)挖掘文章的圖表復(fù)現(xiàn)-10.文章 文章標(biāo)題：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
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空間轉(zhuǎn)錄組分析工具速遞2：Giotto工具官網(wǎng)：https://rubd.github.io/Giotto_site/[https://rubd.github.io/Giotto_site/]代碼官網(wǎng)：https...
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UTR是否屬于外顯子？怎樣直接從refGene中提取位置？寫在前面 前一段時(shí)間幫助同事提取一些基因的UTR（Untranslated Region）在染色體上的位置。在我的印象中，UTR的概念很明確，但是定位很模糊。我知道它是位于m...
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Linux Snippy基因組分析軟件環(huán)境搭建及使用Snippy****基因組分析軟件環(huán)境搭建及使用 官方文檔：https://github.com/tseemann/snippy[https://github.com/tse...
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跟著Molecular Systems Biology學(xué)作圖：R語言ggplot2多圖拼接工具patchwork論文 A genome-scale TF-DNA interaction network of transcriptional regulation of Arabidops...
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vConTACT2病毒分類注釋文章：Taxonomic assignment of uncultivated prokaryotic virus genomes is enabled by gene-sh...
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表觀遺傳學(xué)忠實(shí)粉，不定時(shí)更新科普文獻(xiàn)，歡迎關(guān)注一起交流～
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CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進(jìn)化樹+啟動(dòng)子圖的單獨(dú)或組合圖1. 軟件簡介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫和PySide2庫進(jìn)行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件，主要用于生物信...
