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240 發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地:新疆
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    極端的環(huán)境條件導(dǎo)致了北美大西洋鮭魚種群結(jié)構(gòu)變化

    文章來源:[Environmental extremes drive population structure at the northern range limit of ...

  • 笑死了,哈哈哈

    見過夫妻店的軟件公司沒?

    這大概是15年前的事情,當(dāng)時(shí)我還在一家外資軟件公司當(dāng)開發(fā)小組長(zhǎng)。有一天接到我堂姐的電話,說她那邊的親戚,一對(duì)夫妻開了個(gè)軟件公司,要一個(gè)技術(shù)經(jīng)理,她就介紹了我。 要說這對(duì)夫妻也...

  • 用bedtools快樂到不敢想象

    如何從多個(gè)文件中取交集?

    比如我有很多個(gè)文件(100或者1000個(gè)以上),每一個(gè)文件都包含兩列信息,一列是染色體的位置信息,一列是它對(duì)應(yīng)的值,但是這些文件的行數(shù)不完全一樣。如果我想快速的找到所有文件的...

  • @suki_41b5 可以啊

    互相監(jiān)督讀文獻(xiàn)

    有分子生物學(xué)專業(yè)的小伙伴沒,有想交流監(jiān)督讀文獻(xiàn)的嗎

  • 互相監(jiān)督讀文獻(xiàn)

    有分子生物學(xué)專業(yè)的小伙伴沒,有想交流監(jiān)督讀文獻(xiàn)的嗎

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    我的GWAS高級(jí)曼哈頓圖折騰過程

    如果說別人畫圖是折騰自己,那我畫圖可能就是折騰自己兼折騰群主.......首先在這里感謝何大哥哈(知乎:hewm2008)、很耐心的為我解答了許多問題。 首先簡(jiǎn)要的說一下我這...

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    生物信息數(shù)據(jù)質(zhì)控詳解(全基因組)第一輯

    目標(biāo) 全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 在鑒定單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 和表型特征之間的關(guān)聯(lián)方面變得越來越流行。GWAS 方法通常應(yīng)用于社會(huì)科學(xué)。但是,需要仔細(xì)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,...

  • pi分析

    單個(gè)群體的基因組選擇信號(hào)分析(pi分析) Pi值 Tajima D; Pi主要用來衡量每個(gè)site的nucleotide divergency.(π) test.vcf為輸入...

  • fst計(jì)算

    FST分析 首先將plink文件轉(zhuǎn)化成VCF文件(轉(zhuǎn)換方法見plink章)準(zhǔn)備兩個(gè)種群文件sample1andsample2 sample1代表一個(gè)群體ID sample2代...

  • plink參考

    PLINK語法體驗(yàn) by張成龍 郵箱:yianquanwl@qq.com[mailto:yianquanwl@qq.com] 該教程參考鄧飛博客與自己總結(jié) plink軟件是G...

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    基因流分析——D統(tǒng)計(jì)

    基本概念 基因滲入(introgression): 是在遺傳學(xué)中,指兩個(gè)基因庫(kù)間的基因流動(dòng),通常是經(jīng)過種間雜交產(chǎn)生?;驖B入是一個(gè)長(zhǎng)期的過程,它可能需要許多代雜交才能產(chǎn)生回交...

  • snp曼哈頓圖繪制

    使用CMplot包繪制環(huán)形曼哈度圖 安裝并加載所需R包 基本用法 常用參數(shù) 加載并查看示數(shù)據(jù) 基本數(shù)據(jù)格式: 默認(rèn)繪圖(分別繪制出SNP密度圖,曼哈頓圖,環(huán)形曼哈頓圖和QQ圖...

  • 生物信息基礎(chǔ)

    生物信息基礎(chǔ)(計(jì)算機(jī)方面) by張成龍 此篇為開篇,大多為自己總結(jié)和參考老劉的老本 PLINK文件格式 自從plink更新到1.9/2.0以后,它接受多種輸入格式,常用的是它...

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