寫(xiě)文章，不要求對(duì)每一個(gè)人都有用 寫(xiě)文章，我是要求有用的，但我不要求對(duì)每一個(gè)人都有用，我覺(jué)得我也做不到。我不是狂妄的人。 我寫(xiě)文章，追求邏輯性。跟一位文友一樣，喜歡用比較分析的...
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寫(xiě)文章，不要求對(duì)每一個(gè)人都有用
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使用python從cds或蛋白質(zhì)fasta文件中提取最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本
提取最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本是一個(gè)常見(jiàn)的功能,本腳本會(huì)生產(chǎn)兩個(gè)文件maxpep文件為僅含有最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的fasta文件,maxpep.list為最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本的列表原文件格式如下,這是其中一個(gè)基...
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Smart is the new Sexy
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跑通GWAS，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來(lái)mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組-結(jié)構(gòu)分析
作者：Arno審稿：童蒙編輯：angelica 引言 Iso-seq測(cè)序經(jīng)初步分析獲得高質(zhì)量的轉(zhuǎn)錄本之后（全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本鑒定，全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本比對(duì)），便可以對(duì)轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)進(jìn)行精確鑒定、...
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全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本與參考基因組比對(duì)
作者：Aron審稿：童蒙編輯：amethyst 引言 長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)的突破使得轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)鑒定、可變剪切等分析更為準(zhǔn)確。上一期我們介紹了Iso-seq方法鑒定全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本：全長(zhǎng)轉(zhuǎn)...
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新手 | 青年基金申請(qǐng)流程寫(xiě)在前面 最近也加入了“寫(xiě)本子”大軍。在新的領(lǐng)域暫無(wú)足夠積累，但今年在大伙的鼓勵(lì)下，我還是結(jié)合自己的能力屬性，想了一個(gè)主題，并快快鼓搗出來(lái)。無(wú)論如何，做得如何另說(shuō)，有沒(méi)有做才...
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生信阿拉丁，為實(shí)用而生
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如何利用泛基因組來(lái)深度發(fā)掘一個(gè)物種？
作者：童蒙編輯：amethyst 大豆是一種非常重要的油料和蛋白質(zhì)來(lái)源。為了研究其基因組多樣性，需要構(gòu)建高質(zhì)量的泛基因組。作者denovo組裝了26個(gè)代表性的大豆，同時(shí)對(duì)28...
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基因家族分析保姆級(jí)教程（分子進(jìn)化）-生信小白自學(xué)之路（一）一、基因家族基礎(chǔ)知識(shí)與研究思路介紹 1.基因家族簡(jiǎn)介 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域（內(nèi)含子外顯子啟動(dòng)子）。轉(zhuǎn)錄本才是基因的研究實(shí)體，轉(zhuǎn)錄本transcript（別名 ...
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基因家族擴(kuò)張或收縮基因家族擴(kuò)張或收縮，進(jìn)化樹(shù)1[http://www.itdecent.cn/p/8c6ef557cc71?from=singlemessage] 2[https://ww...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程（1）寫(xiě)在前面：非常感謝CJ開(kāi)發(fā)出如此強(qiáng)大的TBtools工具，作者詳細(xì)講解了基因家族的分析過(guò)程和意義，課程購(gòu)買(mǎi)地址，講的很棒，可以試聽(tīng)。 一共分為4個(gè)部分TBtools基因家族分...
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郵箱：1308487890@qq.com<br>~歡迎相互交流學(xué)習(xí)~
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基因家族分析 | 基因家族成員鑒定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)<br>園藝植物生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
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【python】如何從github上手動(dòng)裝python包？以feature-selector為例首次手動(dòng)裝包本文記錄我裝feature-selector的過(guò)程參考鏈接 1、下載包 https://github.com/WillKoehrsen/feature-selec...
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【生信】HMMER：hmmbuild自建hmm文件參考：https://www.omicsclass.com/question/705 首次用hmmsearch對(duì)我的蛋白質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)域搜索，最終只得到30個(gè)結(jié)構(gòu)域。 拿這30個(gè)...
