發(fā)簡(jiǎn)信
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??UTMOST(跨組織轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究)+FUSION+FOCUS+MAGMA+孟德爾視屏簡(jiǎn)介 UTMOST(跨組織轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)研究)+FUSION+FOCUS+MAGMA+孟德爾隨機(jī)化_嗶哩嗶哩_bilibili[https://...
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??性狀/疾病間的共同遺傳研究項(xiàng)目?jī)?nèi)容 流程簡(jiǎn)介 軟件安裝 參考數(shù)據(jù)介紹 GWAS數(shù)據(jù) 安裝Fast2TWAS包 GWAS數(shù)據(jù)的預(yù)處理 LDSC計(jì)算遺傳相關(guān)性 LDSC計(jì)算p...
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??孟德爾隨機(jī)化之Exposure data
一、暴露因素的數(shù)據(jù)要求： 1.對(duì)于暴露因素的GWAS數(shù)據(jù)，TwoSampleMR需要一個(gè)工具變量數(shù)據(jù)構(gòu)成的data frame，每行對(duì)應(yīng)一個(gè)SN...
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??孟德爾隨機(jī)化之Introduction
1. 安裝孟德爾隨機(jī)化分析相應(yīng)的R包 2. 概述： 孟德爾隨機(jī)化流程如下： 選擇暴露的工具變量（篩選顯著的SNP[P < 5e-8]，并進(jìn)行LD...
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PWAS+TWAS+共定位+孟德爾隨機(jī)化(適用于精神以及腦部疾病)【新課發(fā)布】TWAS簡(jiǎn)介 全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析 (TWAS, transcriptome-wide association studies) 是把轉(zhuǎn)錄調(diào)控（ex...
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孟德爾隨機(jī)化--初篩孟德爾隨機(jī)化--初篩 各位觀眾老爺們大家好，歡迎來(lái)到蟹道人的生信小課堂！ 本節(jié)內(nèi)容我們主要講解如何進(jìn)行孟德爾隨機(jī)化暴露與結(jié)局的快速初篩。 主要列...
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TCGA中RNA-seq數(shù)據(jù)根據(jù)基因的表達(dá)量分組代碼保存位置: /mnt/vol2_ws/test/projects/xcy/data/2021-8-12-liang/data/11/tcga...
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linux系統(tǒng)下文件矩陣轉(zhuǎn)置
col-row.sh 代碼運(yùn)行(速度較慢) sh col-row.sh input.txt > output.txt col-row2.sh 代...