一、Metascape簡介 Metascape(http://metascape.org/[http://metascape.org/]) 是一個功能強大的基因功能注釋分析工...
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記錄一個主頁曹洋課題組 | Labshare 生物信息學(xué)在線軟件集錦地址:http://www.labshare.cn/biosoft/index.html[http://w...
TCGA-204-使用firehose網(wǎng)頁工具 ucsc中的xena整理的數(shù)據(jù)非常全,但這個瀏覽器只能做感興趣的一個一個基因,當我們沒有感興趣的基因怎么辦呢? 谷歌搜索-fi...
本系列為 RNA-Seq 分析具體實現(xiàn)過程,將具體描述流程及可執(zhí)行代碼~本次復(fù)現(xiàn)文章來自 Nature communication,題目為:Temporal and Spa...
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq數(shù)據(jù)分析流程 一、測序數(shù)據(jù)的介紹 測序數(shù)據(jù)主要有兩個來源 1、自測的測序數(shù)據(jù);2、SRA數(shù)據(jù)庫下載;這里介紹SRA數(shù)據(jù)庫下載。 ...
Part0背景知識 Q:什么是外顯子測序呢?A:外顯子組測序是指利用序列捕獲或者靶向技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA富集后再進行高通量測序的基因組分析方法。外顯子組包含約1%的...
TITLE: 全外顯子測序數(shù)據(jù)分析AUTHOR: Shuntai Yu [TOC] 外顯子是形成mRNA后剪接剩下的部分,包括UTR區(qū)與CDS,而CDS則是真正編碼蛋白的...
在TCGA中,一個患者可能會對應(yīng)多個樣本,如TCGA-A6-6650可以得到3個樣本數(shù)據(jù): TCGA-A6-6650-01A-11R-1774-07TCGA-A6-6650-...