在生物學(xué)分析中,我們經(jīng)常會針對某個基因進(jìn)行生物學(xué)功能分析,比較常見的包括基因結(jié)構(gòu)預(yù)測,功能注釋,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(跨膜域,信號肽),同源基因分析,多序列比對,亞細(xì)胞定位預(yù)測,...
在生物學(xué)分析中,我們經(jīng)常會針對某個基因進(jìn)行生物學(xué)功能分析,比較常見的包括基因結(jié)構(gòu)預(yù)測,功能注釋,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測(跨膜域,信號肽),同源基因分析,多序列比對,亞細(xì)胞定位預(yù)測,...
UTR、外顯子和內(nèi)含子位置和結(jié)構(gòu) 運用在線分析工具GSDS(Gene Structure Display Server)繪制基因內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu)圖網(wǎng)址:Gene Struc...
基礎(chǔ)知識 首先我們了解一些基礎(chǔ)知識(注:文中圖片皆可點擊放大查看?。?啟動子(promoter):與RNA聚合酶結(jié)合并能起始mRNA合成的序列。轉(zhuǎn)錄起始點(TSS):轉(zhuǎn)錄時...
寫在前面 很久很久以前,我就已經(jīng)寫過 GFF3/GTF 注釋信息的部分提取功能。每一個GXF文件,往往包含的兩萬個左右基因(數(shù)萬個轉(zhuǎn)錄本)的外顯子,CDS等信息。而我們一般感...
目標(biāo) 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 依然查看help界面的Protein domains 在上傳數(shù)據(jù)的時候我們發(fā)現(xiàn)多了按鈕,可以從PFAM上上傳數(shù)據(jù),evolview使用的標(biāo)簽名必須與PFAM的...
這一推送將簡單介紹: 1.尋找蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域 2.簡單預(yù)測序列的理化性質(zhì) 4. 預(yù)測蛋白酶降解位點 5.預(yù)測卷曲螺旋區(qū)域(coiled-coil domains) 6. 預(yù)測翻...
最近因為新冠肺,遲遲不能上班,在家閑著想著也要學(xué)習(xí),就查找了和工作相關(guān)的-學(xué)些構(gòu)建質(zhì)粒,那么首先需要學(xué)習(xí)如何看質(zhì)粒圖,下面是這兩天學(xué)習(xí)到的,總結(jié)的記錄一下: 1. 復(fù)制起始位...
1、分析蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位有助于了解:蛋白質(zhì)功能和蛋白質(zhì)互作生物體細(xì)胞器類型:細(xì)胞核蛋白質(zhì)、線粒體蛋白質(zhì)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)、細(xì)胞膜、葉綠體蛋白質(zhì)、高爾基體2、通過生物信息學(xué)在線分...