2022年6月2日，福建農(nóng)林大學(xué)海峽聯(lián)合研究院基因組中心張積森團(tuán)隊在《自然-遺傳學(xué)》（Nature Genetics）上發(fā)表了題為“Genomic insights into...
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IP屬地：青海
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2022《Nature Genetics》甘蔗種質(zhì)資源演化 -
在ProtParam 批量預(yù)測蛋白序列理化性質(zhì)參數(shù)
計算蛋白理化性質(zhì)一般在網(wǎng)站，protparam[https://web.expasy.org/protparam/]此網(wǎng)站只可以一次輸入一條序列，結(jié)果需要挨個復(fù)制。當(dāng)序列條數(shù)...
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vcf文件中短序列插入缺失（INDEL）標(biāo)準(zhǔn)化問題：INDEL在vcf文件中表示的非唯一特性 INDEL 在Wikipedia中的解釋： Indel is a molecular biology term for an ...
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命令行中tassel的使用
tassel需要Java環(huán)境 downloads tassel_5 添加到環(huán)境變量中 命令行的tassel有很多的plugin，可以使用下面的命令查看包含了那些plugin ...
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深度學(xué)習(xí)中神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)層，神經(jīng)單元的設(shè)置，以及調(diào)參指導(dǎo)
在學(xué)習(xí)了吳恩達(dá)的課程以后，把吳老師講解的調(diào)參方法用到實驗中，感覺有了方向，節(jié)省了很多時間。寫點(diǎn)筆記，記錄一下實驗心得。以下有部分是個人理解，有疑問的歡迎交流。 一，設(shè)置與調(diào)整...
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【R去重】 保留第一個重復(fù)/去所有的重復(fù)參考： R語言第二章數(shù)據(jù)處理③刪除重復(fù)數(shù)據(jù)果子學(xué)生信 1.保留第一個重復(fù): A,A,B,C --->A,B,C2.去掉所有重復(fù):A,A,B,C --->B,C一般情況函數(shù)默認(rèn)...
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選擇blast比對第一條best hit的結(jié)果
blast的結(jié)果中每條contig都會有很多hit，最好不用max_target_hit這個參數(shù)，因為它輸出的是數(shù)據(jù)庫中top的序列而不一定是比對最好的序列，即使所有版本都包...
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玉米基因ID轉(zhuǎn)換方法
在玉米的基因或基因組研究中常常需要用到基因ID轉(zhuǎn)換的問題，這里我將用的方法介紹一下： 1. 部分ID新舊版本基因組的基因ID轉(zhuǎn)換—網(wǎng)頁版 ensembl網(wǎng)站的 ID Hist...
