為什么要把光合作用納入育種目標(biāo) 作物產(chǎn)量提升一直是育種工作的核心目標(biāo)。當(dāng)傳統(tǒng)育種策略在光能截獲和收獲指數(shù)方面接近理論極限時(shí)，光合作用效率成為新的突破口。最近德國團(tuán)隊(duì)一項(xiàng)發(fā)表于...
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JXB | 嘗試用光合參數(shù)來做大麥產(chǎn)量的基因組預(yù)測 -
Anthropic發(fā)布生物信息學(xué)專屬基準(zhǔn)，大模型真實(shí)數(shù)據(jù)分析能力達(dá)專家水平Anthropic近期發(fā)布了針對(duì)生物信息學(xué)領(lǐng)域的測試基準(zhǔn)BioMysteryBench。這項(xiàng)測試主要評(píng)估大語言模型在處理真實(shí)且復(fù)雜的生物學(xué)數(shù)據(jù)時(shí)的科研分析能力。傳統(tǒng)的科學(xué)評(píng)估...
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TAG | 貝葉斯神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)高精度可解釋的基因組預(yù)測基因組選擇技術(shù)正在改變動(dòng)植物育種的節(jié)奏。通過全基因組分子標(biāo)記估算育種值，育種家能夠更早更準(zhǔn)地鎖定優(yōu)良基因型，縮短育種周期，提升遺傳增益。但隨著研究深入，兩個(gè)問題逐漸凸顯：深度...
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PlantBiMoE開源：輕量高效的植物基因組基礎(chǔ)模型植物基因組里藏著大量調(diào)控元件和結(jié)構(gòu)信息，它們分布在編碼區(qū)和非編碼區(qū)，參與轉(zhuǎn)錄起始、可變剪接、染色質(zhì)開放等關(guān)鍵過程。這些區(qū)域堿基組成不均、依賴關(guān)系長、交互復(fù)雜，傳統(tǒng)窗口式模型很...
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50萬英國人基因數(shù)據(jù)被掛閑魚，Nature刊文警告：信任已經(jīng)不夠了2026年4月23日，英國生物銀行（UK Biobank，以下簡稱UKB）首席執(zhí)行官Rory Collins發(fā)現(xiàn)了一個(gè)令人震驚的事實(shí)：提供給三家中國研究機(jī)構(gòu)人員使用的約50萬...
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Nature Comm | 玉米雜種優(yōu)勢(shì)的新機(jī)制，trans-eQTL調(diào)控基因表達(dá)的不完全顯性近期，山東農(nóng)業(yè)大學(xué)劉紅軍聯(lián)合內(nèi)布拉斯加大學(xué)楊金良等團(tuán)隊(duì)在Nature Communicaitons 上發(fā)表研究論文：The incomplete dominance of g...
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Hor Res綜述：番茄育種進(jìn)入基因組設(shè)計(jì)時(shí)代
番茄是重要蔬菜與果實(shí)研究模式植物，經(jīng)萬年人工馴化形成現(xiàn)代品種。人工選擇提升產(chǎn)量等性狀，但造成遺傳瓶頸、多樣性降低與有害突變積累。當(dāng)前育種轉(zhuǎn)向風(fēng)味與營養(yǎng)，亟需以基因組解析為基礎(chǔ)...
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大豆高蛋白育種新策略：基因挖掘結(jié)合基因組選擇與模擬育種提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遺傳育種的核心目標(biāo)之一。傳統(tǒng)育種依賴多年多點(diǎn)田間表型篩選，周期長且成本較高。東北農(nóng)業(yè)大學(xué)寧海龍教授團(tuán)隊(duì)近期在The Crop Journal發(fā)表研究...
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大豆高蛋白育種新策略：基因挖掘結(jié)合基因組選擇與模擬育種提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遺傳育種的核心目標(biāo)之一。傳統(tǒng)育種依賴多年多點(diǎn)田間表型篩選，周期長且成本較高。東北農(nóng)業(yè)大學(xué)寧海龍教授團(tuán)隊(duì)近期在The Crop Journal發(fā)表研究...
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【米源服務(wù)】生信分析加速計(jì)算（含極速變異檢測）全基因組重測序技術(shù)憑借覆蓋全面、檢測精準(zhǔn)的特點(diǎn)，已成為挖掘功能位點(diǎn)、解析性狀遺傳基礎(chǔ)的重要工具。隨著研究群體規(guī)模的持續(xù)擴(kuò)大，面對(duì)畜禽、水產(chǎn)以及水稻、小麥、玉米、大豆等作物的大...
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生信數(shù)據(jù)格式，是否該為人工智能重新設(shè)計(jì)了？
最近和朋友聊到一個(gè)問題：為什么現(xiàn)在的大語言模型在解讀基因組數(shù)據(jù)時(shí)，效果總差那么一點(diǎn)意思？ 不是模型能力不夠，也不是訓(xùn)練數(shù)據(jù)不足，問題可能出在數(shù)據(jù)格式本身。 比如我們用了十幾年...
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Onerice育種框架：IRRI發(fā)布的一套面向水稻育種現(xiàn)代化的端到端方案2025年10月，國際水稻研究所（IRRI）公開發(fā)布了其水稻育種現(xiàn)代化的核心成果——Onerice育種框架，其宣稱該框架已在IRRI及其合作伙伴的育種網(wǎng)絡(luò)中全面落地。那么，今...
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基因挖掘與重要性狀精細(xì)定位技術(shù)服務(wù)指南基因挖掘與性狀定位是連接表型變異與底層核酸序列差異的關(guān)鍵橋梁。長沙米源生物科技有限公司依托高密度變異圖譜與多組學(xué)生信算力，構(gòu)建涵蓋全基因組關(guān)聯(lián)分析、高密度遺傳圖譜構(gòu)建及極端混...
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實(shí)戰(zhàn)總結(jié)：用 rMVP 做植物 GWAS 的標(biāo)準(zhǔn)工作流與避坑指南最近在一對(duì)一輔導(dǎo)一位同學(xué)做全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）項(xiàng)目。他在處理一批水稻的數(shù)據(jù)時(shí)，使用 rMVP 跑流程遇到了幾個(gè)非常典型的坑。從上千萬個(gè)原始變異位點(diǎn)的質(zhì)控過濾，到代碼報(bào)...
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Plant Com | 華中農(nóng)大&上海交大聯(lián)合開發(fā)植物核心啟動(dòng)子AI從頭設(shè)計(jì)框架TargetGAN近日，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)胡學(xué)海&上海交通大學(xué)陸鈺明團(tuán)隊(duì)在Plant Communications 發(fā)表了題為TargetGAN: A generative AI framework...
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黃三文院士領(lǐng)銜植物星球計(jì)劃（PLANeT）發(fā)表Cell陸地植物約有45萬個(gè)物種，構(gòu)成了陸地生態(tài)系統(tǒng)的根基，也支撐著人類文明。從不足0.1Gb到超過160Gb的基因組大小，從以單倍體配子體為主到以二倍體孢子體為主的生活史，從根、葉...
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兩個(gè)育種項(xiàng)目數(shù)據(jù)一合并，基因組預(yù)測精度提升了13%分享近期一篇發(fā)表在 Communications Biology 上比較接地氣的文章：Large scale wheat data integration improves ...
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全基因組重測序及群體遺傳與進(jìn)化分析技術(shù)服務(wù)指南全基因組重測序（Whole Genome Resequencing, WGRS）是對(duì)已知參考基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體或群體測序，通過與參考圖譜比對(duì)，全景式鑒定單核苷酸多態(tài)性（...