1.JTK 使用metacycle包進(jìn)行JTK的分析，其實(shí)metacycle包中可選的分析方法有ARSER(Yang, 2010)，JTK_CYCLE( Hughes, 20...
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生物節(jié)律之metacycle和cosinor分析（1） -
生物節(jié)律之biocycle和cosinor分析--網(wǎng)頁版（3）前面介紹了好幾個(gè)R包，有做振蕩檢測的Metacycle包，對周期限制的比較松，也有做cosinor分析的，限定周期為24小時(shí)。下面解釋幾個(gè)網(wǎng)頁版的工具1.BIO_CYCLE ...
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生物節(jié)律之振蕩節(jié)律檢測（4）前面我們主要介紹的都是做cosinor分析的，下面介紹幾個(gè)只是用來檢測振蕩是否顯著的R包，畢竟多掌握點(diǎn)使用工具總是好的 1.Rain::rain rain()使用非參數(shù)方法檢...
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生物節(jié)律之cosinor分析（2）cosinor分析之前已經(jīng)介紹過兩個(gè)了（cosinor，cosinor2），其實(shí)R中還有三個(gè)包可以進(jìn)行cosinor分析（card::cosinor，season::cosi...
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生物節(jié)律之cosinor分析——終極R包c(diǎn)ircacompare（5）前面我們已經(jīng)介紹了cosinor差異分析最常用的兩個(gè)包：cosinor和cosinor2包，這兩個(gè)包其實(shí)已經(jīng)做得非常好了，就是還有一點(diǎn)點(diǎn)缺陷，下面一起來看看它們的缺陷： 1....
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2019龍星計(jì)劃筆記-Linux的基礎(chǔ)知識(shí)Linux與生活中常用的Windows系統(tǒng)有著本質(zhì)的區(qū)別；下面看一下百度百科對Linux的定義。 Linux是一套免費(fèi)使用和自由傳播的類Unix操作系統(tǒng)，是一個(gè)基于POSIX...
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GOplot 可視化基因富集分析結(jié)果GOplot 包通過封裝好的函數(shù)可視化基因功能分析結(jié)果。 #1. 安裝 #2. GOplot 內(nèi)置數(shù)據(jù) ##2.1 腦和心臟內(nèi)皮細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) 來自文章Nolan et a...
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Anaconda 介紹、安裝和使用指南(詳細(xì)版本)1. Anaconda 與 Conda 是什么？ 1.1 什么是 Anaconda Anaconda 是一個(gè)用于python/R科學(xué)計(jì)算和機(jī)器學(xué)習(xí)的開源工具(也稱為Pytho...
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【r<-ggplot2】條形圖與線圖問題 你想要?jiǎng)?chuàng)建基本的條形圖與線圖 方案 想要使用ggplot2繪制圖形，數(shù)據(jù)必須是一個(gè)數(shù)據(jù)框，而且必須是長格式。 基本圖形，離散x-axis 使用條形圖，條形的高度通常代表...
