0、R包安裝 1、差異表達(dá)矩陣 2、基因差異分析(三選一就可以進(jìn)行后續(xù)分析) 測(cè)序的數(shù)據(jù)，DESeq2 ，edgeR一般用的比較多，接受的是RNAseq的count數(shù)據(jù)，非l...
IP屬地：內(nèi)蒙古
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TCGA-數(shù)據(jù)整理（counts =》表達(dá)矩陣）
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R語言：TCGA數(shù)據(jù)分析一
引言 我最近在做TCGA數(shù)據(jù)分析，在處理中遇到的問題及其收獲。主要包括： case ID 大小寫處理 數(shù)據(jù)的匹配 涉及到的函數(shù)有： 小寫 tolower 大寫 touppe...
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GSEA學(xué)習(xí)筆記春節(jié)后的第一次寫學(xué)習(xí)筆記，還是要提醒大家沒事別聚集、別聚集、別聚集！重要的事情說三遍！ 前幾天看到公眾號(hào)里寫了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多網(wǎng)上的教程走過一遍GSEA分析...
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ChAMP 分析甲基化芯片數(shù)據(jù)-差異分析下篇
對(duì)于甲基化芯片的差異分析，除了有探針?biāo)降牟町惙治?，還有差異甲基化區(qū)域DMR分析。 差異甲基化區(qū)域的示意圖如下： 該圖片來自Bumphunter的文獻(xiàn)，圖中綠色矩形代表的就是...
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Day01 Markdown練習(xí)--王今日學(xué)習(xí)筆記 1.如何學(xué)習(xí) 討論交流 簡書記錄學(xué)習(xí)筆記 2.如何解決學(xué)習(xí)中的問題 正確使用搜索引擎 正確提問 3.學(xué)習(xí)平臺(tái)的構(gòu)建 幕布
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Day1-學(xué)習(xí)平臺(tái)-ZW一、學(xué)習(xí)小組的正確打開方式 1.如何學(xué)習(xí) （1）電腦看教程 （4）完成后@花花 二、如何搭建高效的學(xué)習(xí)平臺(tái) 幕布 代碼引用 Hello world 多段代碼引用 本地圖片上傳
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fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)-解答
fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí) 原文鏈接 這個(gè)是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據(jù)： 1)統(tǒng)計(jì)reads...
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生信人的linux考試20題
一、 在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列 這個(gè)題目考的mkdir -p的用法，詳見Linux Day1: cd/pwd/mkdir...
