上期介紹了《一篇醫(yī)學(xué)微生物組16S測(cè)序文章必備的五個(gè)內(nèi)容 | 微生物專題》，接下來(lái)我們逐一介紹這些必備內(nèi)容需要用哪些圖片來(lái)直觀呈現(xiàn)，以及這些圖片的含義。 什么是Feature...
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一篇醫(yī)學(xué)微生物組16S測(cè)序文章必備的六張圖 | 微生物專題 -
我以為熱圖只能畫(huà)數(shù)值型數(shù)據(jù)，沒(méi)想到離散型的也行啊離散熱圖 0.需求 今天在群里看到一個(gè)非常漂亮的熱圖，我以為是什么奇怪的新R包畫(huà)的，轉(zhuǎn)了一圈發(fā)現(xiàn)原來(lái)還是大名鼎鼎的ComplexHeatmap丫。今天的代碼都是在作者寫(xiě)的書(shū)基...
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R中KM分析計(jì)算HR以及l(fā)og rank p值
KM分析中需要的包 幾個(gè)函數(shù)的作用 surv 構(gòu)建對(duì)象survfit 擬合生存曲線survdiff 差異檢驗(yàn) 代碼鴨 補(bǔ)充知識(shí)點(diǎn)----計(jì)算KM的HR 如果出現(xiàn)報(bào)錯(cuò) 請(qǐng)檢查一...
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T細(xì)胞marker各類白細(xì)胞百分比為：中性粒細(xì)胞60～70％，嗜酸性粒細(xì)胞0.5～5％，嗜堿性粒細(xì)胞0～1％，淋巴細(xì)胞20～40％，單核細(xì)胞3～8％。
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maftools畫(huà)瀑布圖（oncoplot）什么是瀑布圖 這種由麥肯錫顧問(wèn)公司所獨(dú)創(chuàng)的圖表類型，因?yàn)樾嗡破俨剂魉环Q之為瀑布圖( Waterfall Plot)。瀑布圖具有自上而下的流暢效果，也可以稱為階梯圖（Cas...
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R語(yǔ)言分組箱線圖添加顯著性標(biāo)記簡(jiǎn)單小例子部分示例數(shù)據(jù)如下 第一列是數(shù)值 第二列是處理一-第三列是處理二 最終出圖如下 這里自動(dòng)做統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的函數(shù)是 stat_compare_means() 首先是做箱線圖和小提琴圖的...
