BLAST的主要理念 blast是區(qū)段比對,對于給定的兩個(gè)序列,blast會把具有相似性的片段(hit)找出來,顯示的是hit的信息。 Search may take pla...
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把read比對到基因組之后,需要提取唯一比對來進(jìn)行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都沒有只輸出唯一比對的命令,所以需要對比對結(jié)果sam文件進(jìn)行提取,可以通過sam...
我這里先拋出問題,我手上有套數(shù)據(jù):包含三列,第一列ensgid、第二列symbol,第三列fpkm值。數(shù)據(jù)問了老師,老師說相同的ensg對應(yīng)的fpkm值,求均值。所以針對上方...
R語言傳參快速使用腳本 簡便版 進(jìn)階版 getopt方法 optparse方法1 optparse方法2 R使用getopt包傳參 補(bǔ)充:系統(tǒng)自帶的傳參方法commandAr...
bedtools工具包bamtofastq轉(zhuǎn)換工具 picard中的SamToFastq轉(zhuǎn)換工具 samtools亦可進(jìn)行bam文件(到fq)的轉(zhuǎn)換 總結(jié)一下 此三種方法,某...