BLAST的主要理念 blast是區(qū)段比對，對于給定的兩個(gè)序列，blast會把具有相似性的片段（hit）找出來，顯示的是hit的信息。 Search may take pla...
IP屬地：廣東
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blast主要方法使用總結(jié)（Linux） -
HISAT2 Bowtie2 提取唯一比對 unique mapping reads
把read比對到基因組之后，需要提取唯一比對來進(jìn)行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都沒有只輸出唯一比對的命令，所以需要對比對結(jié)果sam文件進(jìn)行提取，可以通過sam...
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??[linux]awk按照某列分組求另一列均值
我這里先拋出問題，我手上有套數(shù)據(jù)：包含三列，第一列ensgid、第二列symbol，第三列fpkm值。數(shù)據(jù)問了老師，老師說相同的ensg對應(yīng)的fpkm值，求均值。所以針對上方...
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R語言傳參2022-08-24
R語言傳參快速使用腳本 簡便版 進(jìn)階版 getopt方法 optparse方法1 optparse方法2 R使用getopt包傳參 補(bǔ)充：系統(tǒng)自帶的傳參方法commandAr...
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bam2fastq(bam文件轉(zhuǎn)fq/fastq)
bedtools工具包bamtofastq轉(zhuǎn)換工具 picard中的SamToFastq轉(zhuǎn)換工具 samtools亦可進(jìn)行bam文件（到fq）的轉(zhuǎn)換 總結(jié)一下 此三種方法，某...
