西澳大學生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
發(fā)簡信
IP屬地：四川
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微信公眾號：R語言和Python學堂
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記錄學習生信的點滴
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收集一些生物信息學的分析流程的文章。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預后標志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構建與分析 ?? 群體遺傳學分析 ?? 全基因組關聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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CHIMERAX的使用通過Chimerax Userguide 和tutorial 的學習記錄 基本鼠標操作 鼠標左鍵移動——默認旋轉(zhuǎn) 鼠標滾輪——放大縮小 shift+ 鼠標左鍵移動 / ctr...
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LINUX環(huán)境變量（學習筆記）
每個進程都有其各自的環(huán)境變量設置，即要想某個特定的程序能夠運行，需要先設置其環(huán)境變量，這樣在此環(huán)境中該project才能正常工作。 .dll文件（動態(tài)鏈接庫），包括源代碼、數(shù)...
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MCMC抽樣法（學習筆記）前言： 后驗分布種給出了每個參數(shù)值的可能性，但很難看出完整的分布，也無法用分析解決。于是我們需要MCMC法； MCMC法有兩大要素：蒙特卡羅模型和馬爾可夫鏈 蒙特卡羅模型 蒙...
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EMBOSS命令行使用
EMBOSS 序列提取程序 extractseq 雙序列比對 needle water stretcher: 改進的Needleman-Wunsch動態(tài)規(guī)劃算法局相似性雙序列...
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深度洞察產(chǎn)業(yè)，厘清行業(yè)未來。
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