背景 原始數(shù)據(jù)下載專(zhuān)題到最后一個(gè)工具啦，前面介紹的很多工具都是下載原始的測(cè)序數(shù)據(jù)的，而這個(gè)則不同，它是NCBI官方推出的用于查詢(xún)和獲取基因、基因組數(shù)據(jù)的工具。 NCBI的官方...
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原始數(shù)據(jù)下載專(zhuān)題 | datasets——基因與基因組數(shù)據(jù)查詢(xún)和獲取的NCBI官方解決方案
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全基因組重測(cè)序流程【超細(xì)致！！】
自己在研究生的第一個(gè)項(xiàng)目就是處理重測(cè)序數(shù)據(jù)，在做的過(guò)程中參考了很多資料，現(xiàn)在把整個(gè)重測(cè)序的上游分析流程分享給大家，一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)已經(jīng)幫大家踩過(guò)坑了，相信跟著學(xué)習(xí)實(shí)踐一定能夠收獲...
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統(tǒng)計(jì)中的 Power （功率） 和 PowerAnalysis （功率分析）Power Power：可以正確拒絕零假設(shè)的概率，是一個(gè)0-1 的值。 在統(tǒng)計(jì)中， 我們常常遇到這樣一類(lèi)問(wèn)題： 比較2組樣本是否存在差異（來(lái)自于相同的總體）。比如： 服用了實(shí)...
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都8102年了，還用fastq-dump，快換fasterq-dump吧之前寫(xiě)過(guò)一篇文章Fastq-dump: 一個(gè)神奇的軟件[http://www.itdecent.cn/p/a8d70b66794c]， 詳細(xì)介紹了fastq-dump的用法...
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如何利用R語(yǔ)言進(jìn)行meta分析—詳細(xì)教程（以O(shè)R值和 95%CI作為效應(yīng)尺度進(jìn)行合并）正在閱讀本文的小伙伴你好，利用R語(yǔ)言進(jìn)行meta分析是我比較重要的一次將R語(yǔ)言基礎(chǔ)理論應(yīng)用于實(shí)踐的過(guò)程，并收獲了很好的效果。這個(gè)應(yīng)用也是我的畢業(yè)論文中研究方法的核心思路...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類(lèi)熱圖 pheatmap前言 在前面的章節(jié)中，我們介紹了如何使用 ggplot2 繪制熱圖 ggplot2 繪制熱圖的方式很多，如 geom_raster、geom_tile 等 但通常僅僅繪制熱圖...
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人類(lèi)白細(xì)胞抗原（HLA）基因分型——by不是殺殺 主要組織相容性復(fù)合體（major histocompatibility complex，MHC），又稱(chēng)主要組織相容性復(fù)合基因，是存在于大部分脊椎動(dòng)物基因組中...
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臨床試驗(yàn)：臨床終點(diǎn)(4)-腫瘤常用臨床療效評(píng)價(jià)指標(biāo)
一、基于生存的評(píng)價(jià)指標(biāo) 總生存期(OS，Overall Survival)：是指從隨機(jī)化(random assignment)開(kāi)始至因任何原因引起死亡(death)的時(shí)間(失...
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APD抗菌肽數(shù)據(jù)庫(kù)文獻(xiàn)(2016) APD3: the antimicrobial peptide database as a tool for research and education....
