研究細(xì)胞自噬，你可能遇到的問題都在這！ 原創(chuàng) 瞿飛；經(jīng)作者同意轉(zhuǎn)自 Autophagy歡迎關(guān)注Autophagy公眾號(hào)，并加入細(xì)胞自噬交流群 1、自噬的定義 自噬的定義：細(xì)胞...
發(fā)簡(jiǎn)信
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自噬學(xué)習(xí)開端------自噬從入門到精通
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Conda管理多個(gè)版本的R, pythonConda是一個(gè)非常好用的工具，既可以管理packages，也可以管理和下載軟件，還可以建立多個(gè)虛擬環(huán)境來獨(dú)立運(yùn)行多個(gè)版本的軟件。conda分為anaconda和minico...
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cre flox系統(tǒng)初識(shí)哈哈哈，因?yàn)橹耙恢痹谂R床和實(shí)驗(yàn)室像小陀螺一樣，感覺自己什么都是一團(tuán)糟，什么都不懂。現(xiàn)在開始重新做人，看到什么都去仔細(xì)了解一下，就從組會(huì)上老聽但是并不懂的cre呀，loxp呀...
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如何將Seurat3.0版本的object轉(zhuǎn)換為monocle的CDS
之前Monocle2直接輸入Seurat object只適用于Seuratv2.0版本的Seurat object。官方也在github上的issue處表明暫時(shí)還未有直接將S...
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BiomaRt-進(jìn)行人基因到小鼠基因的ID轉(zhuǎn)換下載安裝包 把自己想轉(zhuǎn)換的人的基因名合并成建立一個(gè)向量 使用這個(gè)包的函數(shù)getLDS 運(yùn)行后得到下面結(jié)果 有個(gè)問題是有個(gè)人的基因在這個(gè)庫(kù)里沒有找到 "GNLY"；沒有搞清楚...
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單細(xì)胞之軌跡分析-3：monocle3軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細(xì)胞之軌跡分析-2：mono...
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帶對(duì)角線和顯著性的相關(guān)性熱圖1.目的 用對(duì)角線熱圖來展示相關(guān)性。上三角形是相關(guān)性p值(顏色和顯著性)，下三角形是相關(guān)系數(shù)，同時(shí)展示兩種信息，也沒有顯得很雜亂。 2.搜索 記得我早先見過，但當(dāng)時(shí)沒感覺這圖...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-1：CellphoneDB常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲(chǔ)存受體、配體以及兩種相互作用...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-18-scRNA包學(xué)習(xí)Monocle2劉小澤寫于19.9.2-第三單元第七講：使用scRNA包學(xué)習(xí)Monocle2筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在：h...
