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SeruatV4
簡單可行的SeruatV4和v5共存的安裝方案_seurat v4安裝-CSDN博客[https://blog.csdn.net/qq_5281...
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cellphonedb安裝
昨天搞了一天，奮戰(zhàn)到10點多。終于搞定cellphonedb的安裝，說說我的心得。 先說說安裝步驟，看似很簡單，其實很心酸 conda crea...
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一種與帕金森疾病相關(guān)的腦細(xì)胞Single-cell genomic profiling of human dopamine neurons identifies a pop...
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R包安裝
一）創(chuàng)建一個新的R環(huán)境 conda create -n R4.2 # 創(chuàng)建名為R3.5的環(huán)境 source activate R4.2 #激活環(huán)...
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strsplit函數(shù)的使用
函數(shù)strsplit用于按照指定的字符把長的字符串分割成短的子字符串， strsplit(x, split, fixed = FALSE) 參數(shù)...
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apply，lapply，sapply,tapply函數(shù)的使用
1）apply apply函數(shù) 將數(shù)據(jù)框或矩陣作為輸入， 用于遍歷數(shù)組中的行或列 apply(x, MARGIN, FUN, ...) ##...
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Seurat,Harmony,LIGER 三種整合軟件比較
常見問題： 1）Seurat CCA整合分析后什么情況下用RNAassay，什么時候用intergratedassay？ conserved c...
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單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的整合
CCA[http://www.idata8.com/rpackage/Seurat/FindIntegrationAnchors.html] 大...
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單細(xì)胞質(zhì)控和標(biāo)準(zhǔn)化1.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于： 深入了解組織中的細(xì)胞異質(zhì)性 。 鑒定未知的細(xì)胞類型 。 鑒定已知細(xì)胞類型的亞型 ，原理是在感興趣的細(xì)胞群中尋找差異...