簡單可行的SeruatV4和v5共存的安裝方案_seurat v4安裝-CSDN博客[https://blog.csdn.net/qq_52813185/article/de...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
-
cellphonedb安裝
昨天搞了一天，奮戰(zhàn)到10點多。終于搞定cellphonedb的安裝，說說我的心得。 先說說安裝步驟，看似很簡單，其實很心酸 conda create -n cpdb pyth...
-
公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南，歡迎大家關(guān)注
-
一種與帕金森疾病相關(guān)的腦細(xì)胞Single-cell genomic profiling of human dopamine neurons identifies a population that se...
-
strsplit函數(shù)的使用
函數(shù)strsplit用于按照指定的字符把長的字符串分割成短的子字符串， strsplit(x, split, fixed = FALSE) 參數(shù)split是用于分割字符串， ...
-
apply，lapply，sapply,tapply函數(shù)的使用
1）apply apply函數(shù) 將數(shù)據(jù)框或矩陣作為輸入， 用于遍歷數(shù)組中的行或列 apply(x, MARGIN, FUN, ...) ####MARGIN按行計算或按列...
-
Seurat,Harmony,LIGER 三種整合軟件比較
常見問題： 1）Seurat CCA整合分析后什么情況下用RNAassay，什么時候用intergratedassay？ conserved cell type marker...
-
這個世界流行離開，但我們卻不擅長告別
-
單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的整合
CCA[http://www.idata8.com/rpackage/Seurat/FindIntegrationAnchors.html] 大樣本整合推薦rpca[http...
-
單細(xì)胞質(zhì)控和標(biāo)準(zhǔn)化1.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于： 深入了解組織中的細(xì)胞異質(zhì)性 。 鑒定未知的細(xì)胞類型 。 鑒定已知細(xì)胞類型的亞型 ，原理是在感興趣的細(xì)胞群中尋找差異基因表達(dá)模式。 從稀有細(xì)胞群中...
-
批次效應(yīng)
搞定TCGA批次效應(yīng)！?[https://www.sci666.com.cn/41622.html] 高通量數(shù)據(jù)中批次效應(yīng)的鑒定和處理 - 系列總結(jié)和更新[https://b...
-
腫瘤微環(huán)境中的基質(zhì)細(xì)胞
腫瘤的形成通常伴隨著瘤床的形成及周圍結(jié)締組織和基質(zhì)的深度改變，最終形成適合腫瘤細(xì)胞生存的微環(huán)境(TME)；過往研究表明腫瘤微環(huán)境中基質(zhì)的關(guān)鍵組份有利于腫瘤細(xì)胞的生長與轉(zhuǎn)移，近...
-
單細(xì)胞相關(guān)文章
單細(xì)胞和常規(guī)聯(lián)合分析（胃癌晚期）[https://mp.weixin.qq.com/s/0lJxdpPIhm7OBgzhe48h7A] Bioconductor[http:/...
