發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
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【R】散點(diǎn)圖（二）數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)來(lái)源 使用的數(shù)據(jù)集mtcars是R自帶的數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)格式說(shuō)明 該數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)類型為data.frame，一共有11列，每一列對(duì)應(yīng)于汽車的...
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【R】散點(diǎn)圖（一）數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)來(lái)源 此次繪圖用的數(shù)據(jù)集是R自帶的數(shù)據(jù)集“iris”（鳶尾花數(shù)據(jù)集）。 數(shù)據(jù)格式解說(shuō) 該數(shù)據(jù)集有5列數(shù)據(jù)，如果是要比較花萼長(zhǎng)度（sep...
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畫一朵花前言 ?在母親節(jié)這天用R畫一朵這樣的花送給媽媽或許是一個(gè)不錯(cuò)的選擇。下面將介紹詳細(xì)步驟。 首先需要安裝這些包 ggplot2 tidyverse...
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limma、DESeq2、edgeR差異分析及繪制韋恩圖不同的時(shí)空以及不同的條件下差異基因分析是RNAseq分析的重要目標(biāo)。差異表達(dá)分析方法包括：基于Read數(shù)目：DESeq、limma和edgeR；...
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不同定量軟件的結(jié)果比對(duì)提取 分別用rsem,kallisto,Salmon定量得到每個(gè)樣本isoform的定量文件,提取了transcript_id一列和count一...
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RSEM進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量利用STAR完成了reads的比對(duì)，接下來(lái)使用rsem進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量。 Build References ?--gtf mouse_ref/ge...
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遞歸
遞歸分類 分解為直接量+小規(guī)模子問(wèn)題不伴隨著參數(shù)角色的變化伴隨著參數(shù)角色的變化（調(diào)用遞歸時(shí)除了縮小參數(shù)，還要調(diào)換參數(shù)的位子） 分解為多個(gè)小規(guī)模子...
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位運(yùn)算位運(yùn)算符 例1：找出落單的數(shù)。 一個(gè)數(shù)組中除了某一個(gè)數(shù)之外，其他的數(shù)字都出現(xiàn)了兩次，請(qǐng)找出這個(gè)數(shù)字；【知識(shí)點(diǎn)】相等的數(shù)做異或被消掉了（A ^ A...
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STAR比對(duì)
建立索引 --genomeDir：索引目錄。（index_dir一定要是存在的文件夾，需提前建好）--genomeFastaFiles：基因組文...