1 Bedtools:一個強大的基因組算法工具集 Bedtools是由猶他大學昆蘭實驗室開發(fā)的基因組算法工具集,它堪稱是基因組分析工具中的瑞士軍刀。Bedtools可以對基因...
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CpG Shores 指的是位于CpG island上下游2kb 以內(nèi)的區(qū)域;CpG Shelves指的是位于CpG shores 上下游2kb以內(nèi)的區(qū)域。
應該一個是上游,一個是下游吧?
甲基化芯片注釋中的CpG shores, open sea 是什么
首先推薦Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/[http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas...
經(jīng)常我們會遇到gff文件要處理。比如用MCScanX時就要這么處理:第一列為染色體,第二列為geneID,第三,四列為基因的起始和終止的位置。如下圖: 這里染色體怪怪的先不管...
旁系同源基因簡單來說就是同一物種內(nèi),通過基因復制產(chǎn)生的不同的兩種基因。 計算直系同源的辦法網(wǎng)上已經(jīng)很詳細,今天我來補充一下計算旁系同源基因ks的辦法。 最簡單方法1 用wg...
文章分別引用自:網(wǎng)易云課堂《用Python自動辦公,做職場高手》網(wǎng)址:https://study.163.com/course/introduction/1006277004...
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請問您指的官方文檔是《MicroRNA targets in Drosophila》這篇文章嗎?如果不是能否告訴我下,謝謝
miRanda和mirSVR:預測miRNA結(jié)合位點的工具歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! 預測miRNA結(jié)合位點的工具很多,以TargetScan為代表的工具,利用結(jié)合位點的保守性進行預測,對于大部分保守的結(jié)合位點而言其準確性較好,然而...
TME(Tumor Microenvironment)這邊打錯了
單細胞轉(zhuǎn)錄組學習筆記-2-文獻理解劉小澤寫于19.6.11-文獻理解 筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在:http://jm.grazy.cn/in...