對(duì)于通路分析結(jié)果的可視化而言,最常用的展現(xiàn)方式就是在通路中高亮顯示富集到的基因。kegg 提供了在Color Pathway 在線(xiàn)服務(wù),可以方便...
本篇接著介紹下列 4種 api 的用法: get conv link 4.ddi get 根據(jù)提供的kegg 標(biāo)識(shí)符,返回特定的記錄,多個(gè)標(biāo)識(shí)符...
對(duì)于大多數(shù)的數(shù)據(jù)庫(kù)而言,API接口可以方便的從數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索數(shù)據(jù)。kegg 數(shù)據(jù)庫(kù)的API 鏈接如下: http://www.kegg.jp/ke...
pathway 建立在ko 數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上,基于我們對(duì)生命活動(dòng)中的分子相互作用和化學(xué)物質(zhì)的反應(yīng)的認(rèn)識(shí),構(gòu)建了復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),采用通路圖的形式,進(jìn)...
復(fù)合糖作為糖類(lèi)與蛋白質(zhì)或者脂質(zhì)結(jié)合的產(chǎn)物 ,在生物中分布廣泛,具有重要的功能。GLYCAN 數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證過(guò)的復(fù)合糖的信息,主要是結(jié)構(gòu)信息...
kegg genes 數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了物種的基因信息。 kegg 使用自己定義的ID 唯一區(qū)別每個(gè)基因,叫做kegg gene ID。 對(duì)于每個(gè)基...
kegg Genome 由organisms,selected viruses 和 Metagenomes 3個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)成。 kegg Orga...
kegg drug 數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)藥物相關(guān)信息的綜合數(shù)據(jù)庫(kù),包括了在日本,美國(guó),歐洲上市的的藥物。所有在日本上市的藥物,不論處方藥還是非處方藥,包...
kegg orthology 數(shù)據(jù)庫(kù)是 kegg 的核心,利用基因在不同物種之間的保守性,使得我們可以在更高層次上解讀基因功能。 pathway...