請一定看這里：寫下來只是為了記錄一些自己的實踐，當(dāng)然如果能對你有所幫助那就更好了，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(normalization)：D...
IP屬地：江蘇
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋 -
WGCNA實例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個假設(shè)：1.相似表達模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布。基于這兩點，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達相似性劃分為不同的模塊...
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GSEA學(xué)習(xí)筆記春節(jié)后的第一次寫學(xué)習(xí)筆記，還是要提醒大家沒事別聚集、別聚集、別聚集！重要的事情說三遍！ 前幾天看到公眾號里寫了GSEA的文章，雖然我之前跟著很多網(wǎng)上的教程走過一遍GSEA分析...
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2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析腫瘤浸潤的免疫細胞（附代碼）因為在網(wǎng)上看了一些視頻，然后用數(shù)據(jù)試了一下，發(fā)現(xiàn)一直在運行，打開代碼一看，發(fā)現(xiàn)是我看不懂的，也不知道哪錯了，在網(wǎng)上搜了半天，不是要錢就是故意給你改錯的，網(wǎng)頁版的注冊還不成功，...
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ID轉(zhuǎn)換大全-2-illumina芯片的探針
ID轉(zhuǎn)換大全-2-illumina芯片的探針 基礎(chǔ)知識參見： NCBI的基因entrez ID相關(guān)文件介紹 ID轉(zhuǎn)換大全 生信人必須了解的各種ID表示方式 參考https:/...
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基因id轉(zhuǎn)換方法
1.一開始是在DAVID中：不過轉(zhuǎn)換后的結(jié)果有些不全； https://david.ncifcrf.gov/ 2.后來用的biomart：這兩天突然升級更新用過不了，不過應(yīng)該...
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學(xué)習(xí)小組Day2筆記--飯飯一直以來，對服務(wù)器、終端等名詞都懵懵懂懂，至今說不出來個所以然，它們到底是什么，對linux系統(tǒng)也一直敬而遠之。帶著以上問題，我開始了今天的學(xué)習(xí)。 登陸云服務(wù)器 首先，最需要...
