寫在前面 一年前，我看到課題組其他成員在整一個“進(jìn)化保守區(qū)塊”挖掘的工作。說實話，覺得....挺麻煩。于是我寫了一個工具，具體見推文《進(jìn)化保守的基因區(qū)塊-可視化挖掘》。 這個...
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強勢更新 | 進(jìn)化尺度上的基因保守區(qū)塊挖掘 -
如何高效回復(fù)審稿人意見1 站在審稿人的角度考慮問題 1.1審稿人很忙審稿人多是已畢業(yè)博士，在高?；蜓芯可ぷ?，通常比較忙。 1.2審稿工作一般都是免費的。為什么審稿人愿意免費審稿？（1）通過審稿可...
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全基因組復(fù)制 WGD |（一）簡介
01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù)，...
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@4b5cf131c3af 換換samtools的版本試試
跟著Bioinformatics學(xué)數(shù)據(jù)分析:StainedGlass可視化展示基因組水平上的tandem repeat
論文 StainedGlass: interactive visualization of massive tandem repeat structures with ide...
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潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往反映了環(huán)境作用于個體表型的選擇...
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高速！大規(guī)模 (10w+) 基因?qū)?Ka/Ks 計算工具 - TBtools寫在前面 目前還是在繼續(xù)整一些擦邊“比較基因組”的工具。前段時間停下來，原因只有一個：我發(fā)現(xiàn) TBtools 的Simple Ka/Ks Calculator 速度確實不夠快...
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單倍型分析一、什么是單倍型？ 在單倍型分析前，首先需要明白什么是單倍型、什么是基因單倍型？ 一般來講，所謂的單倍型是指同一染色體上不同變異位點的各種線性組合形式。那么基因單倍型自然就是...
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RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
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這個人的github主頁有很多生信相關(guān)的學(xué)習(xí)資料https://github.com/mdozmorov[https://github.com/mdozmorov] _notes結(jié)尾的倉庫名基本都是相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)習(xí)資料
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GWAS學(xué)習(xí)參考資料
https://www.mv.helsinki.fi/home/mjxpirin/GWAS_course/[https://www.mv.helsinki.fi/home/m...
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三元相圖怎么看怎么畫（附R代碼示例）什么是三元相圖 三元圖是重心圖的一種，它有三個變量，但需要三者總和為恒定值。在一個等邊三角形坐標(biāo)系中，圖中某一點的位置代表三個變量間的比例關(guān)系。在群體遺傳學(xué)中，它被稱做Fin...