寫在前面 一年前,我看到課題組其他成員在整一個“進(jìn)化保守區(qū)塊”挖掘的工作。說實話,覺得....挺麻煩。于是我寫了一個工具,具體見推文《進(jìn)化保守的基因區(qū)塊-可視化挖掘》。 這個...
寫在前面 一年前,我看到課題組其他成員在整一個“進(jìn)化保守區(qū)塊”挖掘的工作。說實話,覺得....挺麻煩。于是我寫了一個工具,具體見推文《進(jìn)化保守的基因區(qū)塊-可視化挖掘》。 這個...
1 站在審稿人的角度考慮問題 1.1審稿人很忙審稿人多是已畢業(yè)博士,在高?;蜓芯可ぷ?,通常比較忙。 1.2審稿工作一般都是免費的。為什么審稿人愿意免費審稿?(1)通過審稿可...
01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化(polyploidy)或全基因加倍/復(fù)制(whole genome duplication, WGD)事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù),...
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跟著Bioinformatics學(xué)數(shù)據(jù)分析:StainedGlass可視化展示基因組水平上的tandem repeat論文 StainedGlass: interactive visualization of massive tandem repeat structures with ide...
在自然群體(區(qū)別于強人工選擇)中,如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性,隨著環(huán)境變量的改變而變化,則這些環(huán)境變量往往反映了環(huán)境作用于個體表型的選擇...
寫在前面 目前還是在繼續(xù)整一些擦邊“比較基因組”的工具。前段時間停下來,原因只有一個:我發(fā)現(xiàn) TBtools 的Simple Ka/Ks Calculator 速度確實不夠快...
一、什么是單倍型? 在單倍型分析前,首先需要明白什么是單倍型、什么是基因單倍型? 一般來講,所謂的單倍型是指同一染色體上不同變異位點的各種線性組合形式。那么基因單倍型自然就是...
已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在線工具Idiographica,雖然能繪制直的...
https://github.com/mdozmorov[https://github.com/mdozmorov] _notes結(jié)尾的倉庫名基本都是相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)習(xí)資料
https://www.mv.helsinki.fi/home/mjxpirin/GWAS_course/[https://www.mv.helsinki.fi/home/m...
什么是三元相圖 三元圖是重心圖的一種,它有三個變量,但需要三者總和為恒定值。在一個等邊三角形坐標(biāo)系中,圖中某一點的位置代表三個變量間的比例關(guān)系。在群體遺傳學(xué)中,它被稱做Fin...