在做單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，獲得分群后我們希望知道每個(gè)群的marker基因是什么以此來描述細(xì)胞群的特征。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本（高変基因）或者每個(gè)亞群（差異基...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組WGCNA到底應(yīng)該怎么做？ -
加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA）| 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建 |生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析必備技能一、前言 1.1 概念 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用來描述不同樣品之間基因關(guān)聯(lián)模式...
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[跟著NC學(xué)作圖]--箱線圖本期內(nèi)容為[跟著NC學(xué)作圖]--箱線圖（一個(gè)函數(shù)獲得Mean、SD、P值）-- 箱線圖我們在以前的教程中分享過，但是計(jì)算P值和差異性感覺還是比較復(fù)雜的。我們今天看看發(fā)表在NC...
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2022-10-28記錄我在做cellchat的時(shí)候遇到的Error Code##1 cellchat <- computeNetSimilarity(cellchat, type = "structural") cellchat <- netEmbe...
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復(fù)現(xiàn)SCI論文圖表：棒棒糖圖|漸變|legeng設(shè)置有小伙伴在群里咨詢了一個(gè)圖的做法，如下： （Reference：GRB10 and E2F3 as Diagnostic Markers of Osteoarthritis ...
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【R】一條命令搞定相關(guān)性圖前面小編給大家講解過 ?R計(jì)算多個(gè)向量兩兩之間相關(guān)性[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...
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一個(gè)輕量級繪制熱圖的R包-HeatmapR
目前R中繪制熱圖的方式有很多，常用的如pheatmap、ComplexHeatmap包等，這里再給大家介紹一個(gè)輕量級的R包-HeatmapR包，即無需過多的前期數(shù)據(jù)處理，可同...
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單細(xì)胞分析：細(xì)胞聚類（十）導(dǎo)讀 前面我們已經(jīng)整合了高質(zhì)量的細(xì)胞，現(xiàn)在我們想知道細(xì)胞群中存在的不同細(xì)胞類型 ，因此下面將進(jìn)行細(xì)胞聚類分析。 學(xué)習(xí)目標(biāo) 描述評估用于聚類的主成分?jǐn)?shù)量的方法 根據(jù)重要的主成分...
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【R畫圖學(xué)習(xí)15】啞鈴圖啞鈴圖，又叫做棒棒糖圖。因其形狀和棒棒糖相似而得名，具體來看實(shí)際上是一個(gè)散點(diǎn)和一條線段的組合。棒棒糖圖是散點(diǎn)圖的一種變體，又與柱狀圖非常相似，但其在清晰展示數(shù)據(jù)的同時(shí)，減少了...
