背景 系統(tǒng)管理員經(jīng)常需要SSH 或者telent 遠(yuǎn)程登錄到Linux 服務(wù)器，經(jīng)常運(yùn)行一些需要很長(zhǎng)時(shí)間才能完成的任務(wù)，比如系統(tǒng)備份、ftp 傳輸?shù)鹊?。通常情況下我們都是為每...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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screen掛起的使用
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文獻(xiàn)閱讀|新冠進(jìn)化起源|Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID...文獻(xiàn)：導(dǎo)致 COVID-19 的 SARS-CoV-2 sarbecovirus 譜系的進(jìn)化起源 發(fā)表時(shí)間：2020年7月 文章整體思路 1、無(wú)斷點(diǎn)基因組區(qū)域的重組分析與鑒定...
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太厲害了吧??
WGCNA數(shù)據(jù)導(dǎo)入
進(jìn)行WGCNA要注意，WGCNA輸入（INPUT）的是：行對(duì)應(yīng)著一個(gè)樣品，列對(duì)應(yīng)著探針的矩陣或者數(shù)據(jù)框。 1.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 做基因表達(dá)譜構(gòu)建，我們必須要有這兩個(gè)文件（如圖），前往...
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GSEA算法學(xué)習(xí)GSEA文獻(xiàn)閱讀1.重要解釋Ranked Gene List L：該基因列表為待檢測(cè)的數(shù)據(jù)集（通常為試驗(yàn)獲得的表達(dá)矩陣文件）；Gene Sets S：該基因集為已知功能注釋的...
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Caret Package – A Practical Guide to Machine Learning in R
利用caret包的createDataPartition()函數(shù)將數(shù)據(jù)集分為一定比例的訓(xùn)練集和驗(yàn)證集 Create the training and test dataset...
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GEO與SRA數(shù)據(jù)庫(kù)|編號(hào)的對(duì)應(yīng)與數(shù)據(jù)批量下載一、GEO Datasets各種編號(hào)的意義 首先需要捋清楚GEO Datasets中的各種編號(hào)。 GPL，platform ID。記錄測(cè)序或芯片的平臺(tái)，對(duì)于芯片平臺(tái)，其包含基...
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GEO DataSets數(shù)據(jù)集的高級(jí)檢索與批量篩選根據(jù)所需構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)容，運(yùn)用NCBI的高級(jí)檢索功能，在GEO datasets中進(jìn)行數(shù)據(jù)集的檢索。此處可以對(duì)檢索范圍進(jìn)行詳細(xì)的框定，方便后續(xù)的文獻(xiàn)篩選，提高效率。 得到初步...
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單細(xì)胞測(cè)序文獻(xiàn)閱讀及補(bǔ)充Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications[1] Abstr...
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Linux服務(wù)器配置R
讓我們使用conda search r-base在conda的頻道中檢索： ... r-base 3.5.1 hfb2a302_1009 anaconda/cloud/con...
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WGCNA數(shù)據(jù)導(dǎo)入進(jìn)行WGCNA要注意，WGCNA輸入（INPUT）的是：行對(duì)應(yīng)著一個(gè)樣品，列對(duì)應(yīng)著探針的矩陣或者數(shù)據(jù)框。 1.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 做基因表達(dá)譜構(gòu)建，我們必須要有這兩個(gè)文件（如圖），前往...
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文獻(xiàn)閱讀 | RBPs | Analysis of RNA-protein networks with RNP-MaP defines functional hubs on RNA文獻(xiàn)：通過(guò)RNP-MaP確定RNA與蛋白質(zhì)作用的核心功能區(qū)域的方法來(lái)分析RNA-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò) 發(fā)表時(shí)間：2021年3月 BACKGROUND 作者 生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室，研究領(lǐng)域...
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干貨 | 全基因組CRISPR文庫(kù)篩選數(shù)據(jù)分析——MAGeCKFlute近年來(lái)，全基因組CRISPR文庫(kù)篩選技術(shù)被廣泛應(yīng)用于腫瘤及病毒相關(guān)調(diào)控因子篩選。通過(guò)同時(shí)sgRNA文庫(kù)同時(shí)敲除全基因組的不同基因，經(jīng)流式或藥物篩選目的細(xì)胞表型，并擴(kuò)增sgRN...
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CROP-seq文獻(xiàn)學(xué)習(xí)（CRISPR液滴測(cè)序）最近聽(tīng)了一個(gè)講座，里面提到了一些對(duì)于我來(lái)說(shuō)比較陌生的技術(shù)：CROP-seq、CRISP-seq、Perturb-seq。（雖然這些技術(shù)早在2017年就發(fā)表了）于是就查閱了文獻(xiàn)...