synvisio在線工具 鏈接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.github.io/]之前知道這個工具，但是沒有搞懂...
發(fā)簡信
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跟著Nature Communications學作圖：synvisio在線工具展示MCScanX共線性分析的結果 -
潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往反映了環(huán)境作用于個體表型的選擇...
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生信分析|Minimap2+sniffles calling SVs
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignment program that can find over...
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學會正確選擇多序列比對（coding-sequences）軟件前幾天，實驗室的師弟師妹通過本地blast獲取一些沒有基因組注釋物種的蛋白編碼序列。原本以為可以快速地進行下一步的選擇壓力分析，沒想到卻在多序列比對這一環(huán)節(jié)出現(xiàn)了棘手的問題。...
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circos 學習手冊（八）
ideogram（三） 4、ideogram 修剪 如果你不想繪制整條染色體，則可以選擇創(chuàng)建一個軸斷點并從中刪除一個區(qū)域 可以通過兩種方法實現(xiàn)： 指定要繪制的內容 指定不要繪...
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非模式生物KEGG富集分析寫在前面 因為我研究的物種比較小眾，很多注釋不完全，R包AnnotationHub中也沒有對應信息，所以無法使用公共數(shù)據(jù)庫進行kegg富集分析。所以自己嘗試使用KAAS造一個...
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篩選最長轉錄本問題在此介紹一個可直接篩選的腳本select_longest_transcripts.pl 重點改寫第25, 28, 31, 64正則匹配.gff文件和.cds文件里的信息 篩選...
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基因組共線性分析-JCVI由于忙課題的原因，斷更了好久，雖然斷更的時間內學習到了很多東西，但細想一下還是記錄在自己博客里比較好，方便自己查閱也方便其他人學習 JCVI這個軟件網(wǎng)上有太多教程，再記錄一次...
