空間組學(xué)研究提供了在組織結(jié)構(gòu)的空間基因信息，通過(guò)結(jié)合單細(xì)胞數(shù)據(jù)，能夠描述細(xì)胞類(lèi)型在腫瘤組織中空間分布的差異、細(xì)胞間的相互作用以及免疫細(xì)胞的不同分布對(duì)預(yù)后效果的影響等，為腫瘤的...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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3篇高分文獻(xiàn)教你如何利用DSP空間多組學(xué)技術(shù)開(kāi)展腫瘤研究 -
Nature【IF 69.504】DSP助力神經(jīng)膠質(zhì)瘤進(jìn)展研究今天小編帶來(lái)一篇發(fā)表在Nature上的膠質(zhì)瘤相關(guān)的文章解讀。該文章利用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)找到了一群獨(dú)特的腫瘤細(xì)胞亞群，并利用GeoMx DSP空間轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)技術(shù)確認(rèn)了這群特殊腫...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與類(lèi)器官聯(lián)合在HPV病毒研究中的新思路感染高危型人乳頭瘤病毒(HPV)導(dǎo)致全世界5%的癌癥，包括宮頸癌和口咽癌。HPV16占大多數(shù)，并且持續(xù)的角質(zhì)形成細(xì)胞感染是主要的危險(xiǎn)因素。病毒癌基因在人類(lèi)致癌中的作用已經(jīng)被深...
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Nature | DSP 平臺(tái)助力揭示Y染色體丟失通過(guò)適應(yīng)性免疫逃逸來(lái)驅(qū)動(dòng)腫瘤生長(zhǎng)Y染色體缺失（LOY）與膀胱癌有關(guān)（10-40%），但其臨床和生物學(xué)意義尚不清楚。本研究對(duì)自然發(fā)生的LOY突變型膀胱癌細(xì)胞以及通過(guò)CRISPR-Cas9靶向缺失Y染色體的細(xì)胞...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 | 聚類(lèi)分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述（三）接上回，在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 | 聚類(lèi)分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MDgxMjU0Nw==&mid...
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DSP空間轉(zhuǎn)錄組+空間蛋白組：揭示非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）腫瘤內(nèi)異質(zhì)性并發(fā)掘空間分子標(biāo)志物本研究回顧性納入18例接受雙特異性抗體（bsAb）治療的NSCLC晚期患者（aNSCLC），采用GeoMx?protein和CTA檢測(cè)方案，結(jié)合特定細(xì)胞類(lèi)型的圈選策略（Seg...
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【Nature IF 64.8】DSP助力同質(zhì)癌細(xì)胞進(jìn)行藥物治療后的克隆命運(yùn)研究即使在基因相同的癌細(xì)胞中，對(duì)治療的抵抗也經(jīng)常出現(xiàn)在這些細(xì)胞的一小部分中。初始群體中稀有單個(gè)細(xì)胞的分子差異使某些細(xì)胞對(duì)治療產(chǎn)生耐藥性；然而，人們對(duì)耐藥結(jié)果的變異性知之甚少。在此...
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Nature（IF=69.504) | 單細(xì)胞空間多組學(xué)技術(shù)描繪人類(lèi)乳腺細(xì)胞圖譜人類(lèi)細(xì)胞圖譜計(jì)劃（Human Cell Atlas，HCA）旨在描述人體中每個(gè)細(xì)胞（約37萬(wàn)億個(gè)）的詳細(xì)特征，呈現(xiàn)不同類(lèi)型細(xì)胞在人體組織的三維結(jié)構(gòu)，勾勒他們?cè)谌梭w系統(tǒng)內(nèi)的聯(lián)系...
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單細(xì)胞+空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在類(lèi)器官研究中的研究思路類(lèi)器官作為一種體外細(xì)胞模型，利用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以獲得非常接近體內(nèi)器官的基因組特征，通過(guò)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序進(jìn)一步得出各類(lèi)細(xì)胞的空間分布特征，適用于多個(gè)領(lǐng)域的研究。 ● 研究思...
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百篇文獻(xiàn)匯總精華！想知道單細(xì)胞發(fā)文生信圖片如何使用嗎？單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序是近幾年最熱門(mén)的組學(xué)技術(shù)之一，在很多高分文章中單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)頻繁出現(xiàn)。除去單細(xì)胞數(shù)據(jù)本身質(zhì)量和數(shù)據(jù)中挖掘到的重點(diǎn)分子，數(shù)據(jù)的可視化展示也是一篇文章的組成核心...
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做單細(xì)胞測(cè)序有限制？樣本先固定助力您解決受限問(wèn)題傳統(tǒng)單細(xì)胞測(cè)序在一些方面存在挑戰(zhàn)： 1、縱向研究或多隊(duì)列研究等大型項(xiàng)目樣本量大，在樣本采集和樣本運(yùn)輸方面面臨著挑戰(zhàn)； 2、傳統(tǒng)單細(xì)胞測(cè)序無(wú)法對(duì)生物樣本庫(kù)中經(jīng)過(guò)固定的存檔樣本進(jìn)...
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單細(xì)胞分析雕刻師--常見(jiàn)整合方法比較（一）Preface 隨著單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展和市場(chǎng)的不斷下沉，越來(lái)越多的研究人員都青睞于使用該技術(shù)來(lái)闡明一些生物學(xué)或醫(yī)學(xué)問(wèn)題，使通過(guò)傳統(tǒng)bulk-RNA測(cè)序無(wú)法解決的事情得以...
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百篇文獻(xiàn)匯總精華！想知道單細(xì)胞發(fā)文生信圖片如何使用嗎？單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序是近幾年最熱門(mén)的組學(xué)技術(shù)之一，在很多高分文章中單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)頻繁出現(xiàn)。除去單細(xì)胞數(shù)據(jù)本身質(zhì)量和數(shù)據(jù)中挖掘到的重點(diǎn)分子，數(shù)據(jù)的可視化展示也是一篇文章的組成核心...
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IF 25 | 4D蛋白質(zhì)組助力急性髓系白血病的蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)的研究蛋白質(zhì)作為功能分子，在生命活動(dòng)中起到非常關(guān)鍵的作用。但很多對(duì)于蛋白質(zhì)的研究都是通過(guò)轉(zhuǎn)錄組間接進(jìn)行的。目前基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù)已經(jīng)發(fā)展到4D時(shí)代，timsTOF Pro 4...
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復(fù)旦大學(xué)鄒欣/郝潔團(tuán)隊(duì)通過(guò)構(gòu)建單細(xì)胞新算法scSTAR實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄組分析2023年2月，復(fù)旦大學(xué)鄒欣/郝潔團(tuán)隊(duì)在Briefings in Bioinformatics (IF=14) 以長(zhǎng)文形式發(fā)表了題為：“scSTAR reveals hidd...
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芯周刊·第35期 | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和聯(lián)合ATAC揭示腎透明細(xì)胞癌遺傳調(diào)控特征/// 01 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和聯(lián)合ATAC揭示腎透明細(xì)胞癌遺傳調(diào)控特征 腎細(xì)胞癌是泌尿系統(tǒng)最常見(jiàn)的癌癥之一，腎透明細(xì)胞癌（ccRCC）是最常見(jiàn)的腎細(xì)胞癌組織學(xué)類(lèi)型，是具有潛在的...
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多組學(xué)思路解析水稻葉片淀粉過(guò)量和早衰的調(diào)控機(jī)制葉片中臨時(shí)淀粉的正常代謝對(duì)保證作物光合作用、延緩衰老和保持高產(chǎn)具有重要作用。酪蛋白激酶 I1（OsCKI1）在很多重要生理過(guò)程中起著至關(guān)重要的調(diào)節(jié)作用，包括水稻的根系發(fā)育、激...
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芯周刊·第34期 | 單核細(xì)胞測(cè)序+空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：揭示脊髓損傷后與運(yùn)動(dòng)能力恢復(fù)有關(guān)的特異性神經(jīng)元/// 01 單核細(xì)胞測(cè)序+空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：揭示脊髓損傷后與運(yùn)動(dòng)能力恢復(fù)有關(guān)的特異性神經(jīng)元 本研究發(fā)現(xiàn)在9名慢性脊髓損傷患者的神經(jīng)康復(fù)期間，硬膜外電刺激（EES）可以恢復(fù)患者...
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芯周刊·第33期 | IF 38+湯富酬團(tuán)隊(duì)發(fā)布單細(xì)胞全長(zhǎng)三代測(cè)序技術(shù)新進(jìn)展/// 01 湯富酬團(tuán)隊(duì)發(fā)布單細(xì)胞全長(zhǎng)三代測(cè)序技術(shù)新進(jìn)展 自2016年單細(xì)胞技術(shù)發(fā)展迅速，出現(xiàn)了大量不同原理和分離方案的單細(xì)胞技術(shù)平臺(tái)，但這些平臺(tái)大多數(shù)基于NGS測(cè)序，將RN...