記錄一下分析代碼 1. NGS數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 2. 參考基因組準(zhǔn)備 對(duì)于模式植物，可以從多個(gè)方面補(bǔ)充一些注釋信息，比如GO和KEGG 到這里，原始數(shù)據(jù)及基因組基本準(zhǔn)備完畢，可以進(jìn)入...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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轉(zhuǎn)錄組分析：預(yù)處理和質(zhì)控 -
@榮_e687 eggNOG庫(kù)里面的GO和KEGG數(shù)據(jù)很久不更新了
本地搭建植物KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)及進(jìn)行注釋
KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)包含豐富的功能信息及通路注釋，可由此了解生物系統(tǒng)的功能和效用。 而官方已經(jīng)不再免費(fèi)提供FTP下載氨基酸以及核酸序列庫(kù)，并且KAAS和Kofam等官方工具，要么在...
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R可視化：KEGG富集分析可視化加載R包 加載數(shù)據(jù)集 KEGG富集分析 結(jié)果轉(zhuǎn)換 選取前20項(xiàng)進(jìn)行可視化 給各通路加上對(duì)應(yīng)map號(hào) ggplot2柱狀圖可視化 ggplot2氣泡圖可視化 ggplot2分類...
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本地搭建植物KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)及進(jìn)行注釋KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)包含豐富的功能信息及通路注釋，可由此了解生物系統(tǒng)的功能和效用。 而官方已經(jīng)不再免費(fèi)提供FTP下載氨基酸以及核酸序列庫(kù)，并且KAAS和Kofam等官方工具，要么在...
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無(wú)參物種背景基因GO注釋
相似的基因在不同物種中，其功能往往是保守的。通過GO注釋可獲得跨物種的同源基因及其基因產(chǎn)物的功能描述。對(duì)于非模式生物或者無(wú)參考基因組的項(xiàng)目，經(jīng)常需要進(jìn)行背景基因的GO注釋，以...
