前言 這次學(xué)習(xí)的本體是來自劍橋大學(xué)[https://training.csx.cam.ac.uk/bioinformatics/]: Vladimir Kiselev, Ta...
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Single Cell RNA-seq Analysis 學(xué)習(xí)記錄（一）：原理理解 -
de Bruijn graph組裝基因組的時候，Kmer數(shù)必須是奇數(shù)的原因根本原因就是為了避免導(dǎo)致 正反鏈混淆。 如果kmer是偶數(shù)，我們會發(fā)現(xiàn)基因組上有些序列（如，CGCGCGCG，kmer=4）的Kmer在反向互補后得到的序列仍然是它自身！這是...
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利用Python進(jìn)行數(shù)據(jù)分析（第二版）早鳥版介紹
暑期回家學(xué)車的時候，我為了保持自己的學(xué)習(xí)狀態(tài)，于是去看《利用Python進(jìn)行數(shù)據(jù)分析》。為了能夠運行書上的代碼，我去GitHub上下載它們隨書數(shù)據(jù)，不經(jīng)意間發(fā)現(xiàn)這本書要在今年...
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爬取張佳瑋138w+知乎關(guān)注者：數(shù)據(jù)可視化一、前言 作為簡書上第一篇文章，先介紹下小背景，即為什么爬知乎第一大V張公子的138w+關(guān)注者信息？ 其實之前也寫過不少小爬蟲，按照網(wǎng)上各種教程實例去練手，“不可避免”的爬過...
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【shell筆記>命令|實戰(zhàn)|轉(zhuǎn)載】awk去掉重復(fù)行
1 如果僅僅是刪除內(nèi)容完全一樣重復(fù)行則可以使用sort先進(jìn)行排序 然后使用 uniq進(jìn)行刪除重復(fù)數(shù)據(jù)即可例如 CUST.TXT 第3行與第7行完全相同第一步：sort 進(jìn)行...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)淼氖?6年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level expression analy...
