安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前,先設(shè)置一個小環(huán)境,不要直接在自己賬戶的當(dāng)前環(huán)境內(nèi)安裝軟件;你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名,有的小環(huán)境壞了,你不要就可以了...
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根據(jù)簡書崔女神文章http://www.itdecent.cn/p/071c1757ded1利用hisat2來構(gòu)建小麥的轉(zhuǎn)錄組的索引文件,服務(wù)器內(nèi)存64G,構(gòu)建的命令如下:...
GWAS分析中,找到顯著性SNP,需要注釋,才能找到候選的基因。 什么是注釋呢?我們知道,GWAS的依據(jù)是snp與控制性狀的基因處于LD狀態(tài),所以,我們才能推斷顯著性的SNP...
共線性分析是指研究基因組或染色體中的基因之間的演化關(guān)系和相關(guān)性的方法。它可以幫助揭示基因重復(fù)事件、基因家族、基因重排和基因功能保留等不同生物過程中的重要信息。在共線性分析中,...
文章轉(zhuǎn)載自 微分基因公眾號http://www.sohu.com/a/273345614_100126902 僅供個人學(xué)習(xí)之用。目前想學(xué)習(xí)泛基因組的知識,把所看到的的文獻(xiàn)記錄...
1 原理 詳細(xì)信息參見2013年的QTL-seq 文獻(xiàn),這里只做簡單介紹。 1.1 群體構(gòu)建 QTL-seq 將 BSA(bulked-segregant analysis)...
遺傳圖譜產(chǎn)生的背景 20世紀(jì)開始現(xiàn)代遺傳學(xué)進(jìn)入了一個快速發(fā)展的時期,這時人們已經(jīng)認(rèn)識到生物性狀的遺傳由基因決定,而染色體又是作為基因的載體,整體遺傳給后代?;虻臄?shù)目往往很多...
這個包有點恐怖,想來我寫這個也有點膽戰(zhàn)心驚。http://www.rqtl.org/官網(wǎng)。 我所有的內(nèi)容的都是基于會安裝R包的基礎(chǔ),假設(shè)你已經(jīng)安裝了qtl,當(dāng)開始一項新的項目...
史晏榕, 孫宇輝 摘要: DNA克隆和組裝技術(shù)是重要的分子生物學(xué)工具。近年來,隨著合成生物學(xué)的飛速發(fā)展,對大片段DNA元件的快速有效組裝就顯得尤為關(guān)鍵。同時,各種DNA克隆和...