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Perl語言---批量將fastq格式轉(zhuǎn)換為fasta格式首先介紹fastq的格式和fasta的格式： fastq是測序所得的文件，其內(nèi)部含有對每一個(gè)堿基進(jìn)行質(zhì)量評估的值： 第一行：測序的index；第...
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如何快速下載NCBI上的各個(gè)物種參考基因組我們用普通的瀏覽器的方法下載非常慢： 此時(shí)下載速度非常慢，而且很容易下載中斷，報(bào)錯(cuò)。 那怎么快速下載呢？ 我們只需要進(jìn)入NCBI的FTP： 我們...
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Awk的一般功能2---Read數(shù)的篩除Awk作為linux內(nèi)置的文本數(shù)據(jù)處理工具，具有簡單迅速的特點(diǎn)，在處理上萬行數(shù)據(jù)時(shí)，其相對于EXCEL具有優(yōu)勢突出，因此我們在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的最...
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如何保證發(fā)表SCI文章中的圖片分辨率？一、在進(jìn)行組學(xué)測序以后，公司會(huì)將分析后的數(shù)據(jù)的表格以及對應(yīng)的圖片如火山圖、熱圖、維恩圖以及因子圖等打包發(fā)給你，如這樣： 二、然而當(dāng)你發(fā)表文章的時(shí)...
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生活中的一些小發(fā)現(xiàn)1-鍵盤打字不知道大家打字的時(shí)候有沒有遇到過右手明顯沒有左手靈活的情況 特別是在鍵入鍵盤符號那一部分內(nèi)容的時(shí)候，輸入用的右手很容易脫離標(biāo)準(zhǔn)輸入手型而轉(zhuǎn)為“二...
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關(guān)于數(shù)據(jù)為什么取log作圖？這里給出三張圖可以直觀的看出： 1. 不做處理 **2. 進(jìn)行l(wèi)og2(FPKM+1) ** 無論是取log還是+1都是為了作圖方便，更好的表示...
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Linux工具之a(chǎn)wk的一般功能awk對于我來說強(qiáng)大的功能在于：當(dāng)處理超過5萬行的EXCEL數(shù)據(jù)，Windows頻繁卡死的情況下，在基于linux上的awk處理只需要兩秒。它可...
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perl語言---從參考蛋白庫中提取指定序列需求： PS：綠色部分為蛋白的名稱等信息，后面的黑色部分為對應(yīng)序列 我想把其中的某個(gè)蛋白信息連同它的序列提取出來，變成這樣： 我想要的蛋白序列 ...
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蛋白組分析---用Persues進(jìn)行后續(xù)分析1. 上文中，我們用Maxquant軟件分析了.raw數(shù)據(jù)，最終得到了個(gè)txt命名的文件，長這樣： 2. 接下來，我們下載并打開Persues軟...