網(wǎng)上某火熱的gene family課程，我是看過，應(yīng)該是一年多前（2017）它剛出來的時候看過，當時因為我整個分析都會，想看看它有沒有什么補充的。 現(xiàn)在我寫的這個系列，都是我...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準確率和效率。Trimmomatic 是...
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基因家族擴張與收縮分析及物種進化樹構(gòu)建（上）一、數(shù)據(jù)準備 首先，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...
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跟著Gut學畫圖：R語言ggtree包畫弦圖的簡單小例子今天的推文內(nèi)容是模仿論文 Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts renal failure i...
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利用NetworkAnalyst在線工具對GEO數(shù)據(jù)庫中表達基因進行差異分析上一個課程，我們對NetworkAnalyst在線工具進行概述，簡單回顧一下，我們使用的NetworkAnalyst包括五個功能模塊，分別是 1）Gene list inpu...
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『TBtools-plugin』OneStepWGCNA插件這個插件已經(jīng)下架了，上架了更好用的WGCNA shiny：http://www.itdecent.cn/p/4691c535a522[https://www.jianshu...
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?esquisse: 快速可視化圖形的 Rstudio 插件
默認識別當前環(huán)境中所有的 DataFrame 做為可導(dǎo)入數(shù)據(jù)，自動根據(jù)選擇的變量選擇合適的圖形類型并可手動設(shè)置美學屬性，適合數(shù)據(jù)的快速簡單探索。 復(fù)雜一些的圖可以嘗試通過 I...
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用python做生物信息數(shù)據(jù)分析（2-pysam）寫perl的思維，可能確實不能拿來學python。畢竟，python的褲子有很多。面向?qū)ο蟮恼Z言，如果不好好穿褲子，怎么找對象？。手上要做的事情，需要解析sam，更或者bam...
