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CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有發(fā)生在真核生物 DNA 上的動態(tài)過程都發(fā)生在染色質(zhì)中，包括核小體及其修飾、轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)相關(guān)復(fù)合物。各種染色質(zhì)特征標(biāo)記...
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利用R進(jìn)行數(shù)據(jù)處理一、數(shù)據(jù)讀取 在利用R處理數(shù)據(jù)時，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)會有一些缺失，這時R就會報錯 正如報錯所示，第一行相比于其余行缺一個數(shù)據(jù)，這時我們可以利用 這個函數(shù)跳...
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重新修改單細(xì)胞簇的命名
在單細(xì)胞分析基本流程中，對單細(xì)胞簇命名之后發(fā)現(xiàn)此過程有些錯誤，想要重新命名該如何進(jìn)行，以下代碼可以重新將單細(xì)胞命名修改為原始分群數(shù)。
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構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹如何繪制下圖所示的基因進(jìn)化樹 實例 以綿羊的NPPC基因為例繪制不同物種間的進(jìn)化樹1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列 2.利用NCBI網(wǎng)...
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如何查看基因的外顯子內(nèi)含子區(qū)基因在結(jié)構(gòu)上，分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩部分。真核生物的編碼區(qū)是不連續(xù)的，分為外顯子和內(nèi)含子，在轉(zhuǎn)錄過程中會修剪內(nèi)含子，并拼合外顯子來形成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。...
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aspera批量下載測序原始數(shù)據(jù)
下載aspera 軟件官網(wǎng)：asperasoft.com 這一步推薦下載3.9.0以前的版本，我下載了最新的版本沒有找到私鑰，下載文件過程中會報...
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轉(zhuǎn)錄組測序分析-上游分析一、認(rèn)識轉(zhuǎn)錄組 RNA作為基因組和蛋白質(zhì)組之間的鏈接部分，是分子生物學(xué)中獨特的核心活動。轉(zhuǎn)錄組測序是分析某一組織中的全部RNA的表達(dá)量，包括mR...
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fastqc質(zhì)檢結(jié)果解讀fastq文件在經(jīng)過fastqc文件質(zhì)檢后，一般都會生成一個網(wǎng)頁版的文件，我們可以根據(jù)文件來分析我們的測序結(jié)果的好壞，前提是我們能夠讀懂這個文件...