這次只是對數(shù)據(jù)進行了初步的分析,下次有機會把完整分析過程跑下來??
CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有發(fā)生在真核生物 DNA 上的動態(tài)過程都發(fā)生在染色質中,包括核小體及其修飾、轉錄因子和染色質相關復合物。各種染色質特征標記了活躍和沉默轉錄調控元件和染色...
根據(jù)標準分析流程中組裝的所有轉錄本,生成所有可能的可變剪切事件;請問這樣的話我是否可以用這些可變剪切事件對后面其他所有本物種轉錄組數(shù)據(jù)可變剪切進行分析呢?
SUPPA原理及結果解析SUPPA是一款強大的轉錄本或局部可變剪切分析工具,適用于有多個條件的可變剪切分析,具有靈活、高效及精準等特點。SUPPA具有很多操作模塊,每個模塊可以單獨運行。SUPPA一...
一、數(shù)據(jù)讀取 在利用R處理數(shù)據(jù)時,發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)會有一些缺失,這時R就會報錯 正如報錯所示,第一行相比于其余行缺一個數(shù)據(jù),這時我們可以利用 這個函數(shù)跳過第一行,但大多數(shù)據(jù)并不是僅僅...
如何繪制下圖所示的基因進化樹 實例 以綿羊的NPPC基因為例繪制不同物種間的進化樹1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列 2.利用NCBI網(wǎng)站對NPPC蛋白進行blast...
基因在結構上,分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩部分。真核生物的編碼區(qū)是不連續(xù)的,分為外顯子和內含子,在轉錄過程中會修剪內含子,并拼合外顯子來形成轉錄產(chǎn)物。在原核生物中,基因是連續(xù)的,也...
@神經(jīng)蛙_3abe 可以兩兩比較
單細胞不同組別進行差異基因分析大家做單細胞項目的時候,會涉及到多個組別,在分群之后想進行不同組別的差異基因分析,來查看不同處理對試驗有什么影響。但生信小白只會流程化的分析,在對兩組之間的單細胞進行差異分析...
下載aspera 軟件官網(wǎng):asperasoft.com 這一步推薦下載3.9.0以前的版本,我下載了最新的版本沒有找到私鑰,下載文件過程中會報錯。 查看軟件 1.軟件下載至...
一、認識轉錄組 RNA作為基因組和蛋白質組之間的鏈接部分,是分子生物學中獨特的核心活動。轉錄組測序是分析某一組織中的全部RNA的表達量,包括mRNA,rRNA,tRNA,ln...
fastq文件在經(jīng)過fastqc文件質檢后,一般都會生成一個網(wǎng)頁版的文件,我們可以根據(jù)文件來分析我們的測序結果的好壞,前提是我們能夠讀懂這個文件中顯示的內容,接下來我們主要解...
老師好,不同測序平臺的數(shù)據(jù)可以整合嘛?
10X單細胞轉錄組多物種聯(lián)合分析:以人和小鼠為例10X單細胞轉錄組是可以聯(lián)合分析多個物種的。也許,你會問為什么要分析多個物種,我一個物種的某個器官還整明白呢?其實在做: 模型 移植 免疫 病毒 生殖隔離 的時候,同一個組織...
@小劉同學lls 是的
單細胞不同組別進行差異基因分析大家做單細胞項目的時候,會涉及到多個組別,在分群之后想進行不同組別的差異基因分析,來查看不同處理對試驗有什么影響。但生信小白只會流程化的分析,在對兩組之間的單細胞進行差異分析...