挖掘公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)集時(shí),會(huì)遇到常見(jiàn)各種單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)格式?,F(xiàn)總結(jié)如下,方便自己日后調(diào)用,以創(chuàng)建Seurat對(duì)象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號(hào):GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
R語(yǔ)言繪圖包系列: R語(yǔ)言繪圖包01--優(yōu)秀的拼圖包patchwork[http://www.itdecent.cn/p/e57555d48c91] R語(yǔ)言繪圖包02--熱...
謝謝解答??
單細(xì)胞不同組別進(jìn)行差異基因分析大家做單細(xì)胞項(xiàng)目的時(shí)候,會(huì)涉及到多個(gè)組別,在分群之后想進(jìn)行不同組別的差異基因分析,來(lái)查看不同處理對(duì)試驗(yàn)有什么影響。但生信小白只會(huì)流程化的分析,在對(duì)兩組之間的單細(xì)胞進(jìn)行差異分析...
本教程介紹了Kang等人(2017)的[https://www.nature.com/articles/nbt.4042]兩組PBMC的對(duì)齊方式。在該實(shí)驗(yàn)中,將PBMC分為刺...
上一節(jié)介紹了兩組比較中如何展示差異基因數(shù)目,這一節(jié)的內(nèi)容更進(jìn)了一步,我造了一種圖,可以用來(lái)表示具體的差異基因。 想象一下你的單細(xì)胞數(shù)據(jù)同時(shí)包含對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組,在做完前期的基礎(chǔ)...
你好,請(qǐng)問(wèn)一下,我的兩樣本組是veh和D9,我是直接寫成ident.1 = "veh",
ident.2 = "D9"嗎
單細(xì)胞不同組別進(jìn)行差異基因分析大家做單細(xì)胞項(xiàng)目的時(shí)候,會(huì)涉及到多個(gè)組別,在分群之后想進(jìn)行不同組別的差異基因分析,來(lái)查看不同處理對(duì)試驗(yàn)有什么影響。但生信小白只會(huì)流程化的分析,在對(duì)兩組之間的單細(xì)胞進(jìn)行差異分析...
大家做單細(xì)胞項(xiàng)目的時(shí)候,會(huì)涉及到多個(gè)組別,在分群之后想進(jìn)行不同組別的差異基因分析,來(lái)查看不同處理對(duì)試驗(yàn)有什么影響。但生信小白只會(huì)流程化的分析,在對(duì)兩組之間的單細(xì)胞進(jìn)行差異分析...
時(shí)代的洪流奔涌而至,單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕,飛入尋常百姓家。雪崩的時(shí)候,沒(méi)有一片雪花是無(wú)辜的,你我也從素不相識(shí),到被一起卷入單細(xì)胞天地。R語(yǔ)言和Seurat已以勢(shì)如破竹...