1.利用箱線圖比較兩類樣本的某個細胞比例差異 比較直觀，但是缺點在于如果單細胞樣本個數(shù)過少且異質(zhì)性大，導致很難有統(tǒng)計學顯著意義 2.R o/e 比值 好多文章都有用這個，我的...
IP屬地：上海
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單細胞細胞比例分析方法列舉 -
機器學習入門總結和各類常用神經(jīng)網(wǎng)絡匯總(第一篇)這里總結了李宏毅老師的機器學習的課程。首先我們將會了解到機器學習的概念，但是課程的主要觀點將會聚焦到Deep Learning。進行了解之后我們會學習到監(jiān)督學習( super...
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SignatuR的使用簡介SignatuR包屬于較為簡單的數(shù)據(jù)庫類型的R包，其中已包含了多個生物學過程和細胞類型特異性基因集，基因集的排列方式呈樹形結構，簡單明了，在使用過程中我們可以添加或刪除其中的...
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去醫(yī)院卻撞見老公全家陪別的女人產(chǎn)檢，我淡定拿出老公的不育報告，讓他們狗咬狗
我被籃球砸傷了腳踝，被送到醫(yī)院后，竟然遇到我老公全家，陪另一個女人產(chǎn)檢。 平時對我的冷言冷語的小姑子吳彤彤挽著小三的胳膊，婆婆也噓寒問暖。 我的老公在旁邊一語不發(fā)，甚至和那個...
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論文閱讀“ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell RNA-seq Interpretations”Yu Z, Lu Y, Wang Y, et al. ZINB-based Graph Embedding Autoencoder for Single-cell RNA-s...
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2022-04-07 張澤民老師文章選讀之SciBet as a portable and fast single cell type identifier看了生信人公眾號的推文，才發(fā)現(xiàn)張澤民老師的研究涉獵非常廣，其中很多生信分析和分析工具我豆豆很感興趣，近幾天計劃把老師的研究捋一捋，今天先就選出來的一些感興趣的文章進行閱讀。原...
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17萬年前，智人吃什么？揭秘人類曾食用的巨型蝸牛大家好，歡迎來到今日的《科學快報》 人類曾經(jīng)食用超大型蝸牛？這項實驗揭示了史前文化的秘密 該研究發(fā)表于《自然》雜志 在匈牙利的一個古老遺址中，科學家們發(fā)現(xiàn)了一批巨大的蝸牛骨骼...
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溶酶體和線粒體共存的所思所得幾年前，基于蛋白組數(shù)據(jù)，苦思冥想后提出一個可能的理論： 溶酶體和線粒體可以融合共存。也就是內(nèi)體溶酶體和自噬體融合后，并未發(fā)生傳統(tǒng)的線粒體完全被消化，而是像十幾億年前的原真核細...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它們的聯(lián)系與區(qū)別一、 簡述 ? ? 為了從基因的表達水平中得到更加具體直觀的生物學功能變化的信息，多種基于已知的基因集的分析方法應運而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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預支彩禮被男友拉黑，真的很渣嗎？
最近，一個女生因為父親生病，向交往五年的男友要求預支彩禮反被拉黑的事引起熱議。 很多人認為男生渣，但仔細推敲，遠非如此。 比如，拉黑背后的真相是：女孩父親腦溢血治療已逾70萬...
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跟著Nature學作圖：R語言ggplot2三角熱圖按照指定的角度旋轉論文 Whole-genome doubling drives oncogenic loss of chromatin segregation https://www.nat...
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黃光裕：人生最大的悲哀是，等你滿血復活，卻早已沒有了對手馬爾克斯在《百年孤獨》書中寫道：生命中曾經(jīng)有過的所有燦爛，終究都需要用寂寞來償還，人生終將是一場單人的旅行，孤獨之前是迷茫，孤獨過后便是成長。 很顯然親手創(chuàng)造國美帝國神話的“...
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CIBERSORT 免疫浸潤(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸潤計算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介紹CIBERSORT。 1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly...
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NetAct代碼實操之單細胞轉錄因子分析的新時代
前言 Immugent在之前的一篇推文；NetAct:利用基因活性構建核心轉錄因子調(diào)控網(wǎng)絡[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
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ConsensusClusterPlus: R中實現(xiàn)鑒定簇集數(shù)及其成員的算法無監(jiān)督分析下鑒定簇集數(shù)及成員 Wilkerson, D. M, Hayes, Neil D (2010). “ConsensusClusterPlus: a class di...
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一個科研愛好者對Scientific reports的看法本人今年8月有幸中Scientific reports一篇，不催不黑，專家意見挺專業(yè)的，意見也比較客觀，并提了4個方法學方面的問題，總體感覺不錯。sr官網(wǎng)顯示2019年接收率...
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circos軟件學習筆記：更改染色體的比例、顏色、方向在這一節(jié)，我們將學習如何調(diào)整染色體繪畫條數(shù)，以及改變它們的比例、顏色以及方向。 正確的ideogram的布局是非常重要的。比如說，使所有的染色體都是相同的大小可以強調(diào)模式中相...
