前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn),其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值,(Ka/Ks)。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有,也只是教大家...
序言:種群歷史()是指描述種群大小改變隨著時間變化的一個特定模型。給定一個種群模型能產(chǎn)生很多可能的譜系,不同的譜系導(dǎo)致不同的遺傳變異式樣,也就是說基因組每一個位點(diǎn)都有一個特別...
不知道你說的下一步是指什么,以上步驟是我在windows子系統(tǒng)中成功安裝的
群體結(jié)構(gòu)推斷軟件FastStructure安裝的詳細(xì)指南此款軟件是基于SNP位點(diǎn)進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)的推斷,運(yùn)行速度比較快一些,本文主要介紹它的詳細(xì)安裝步驟。一、安裝fastStructure的依賴包和庫:Cython,Scipy,Num...
pyGenomeTracks是什么 首先在介紹pyGenomeTracks之前, 先說幾個常用的表觀組學(xué)數(shù)據(jù)展示工具,IGV,UCSC和WashU。其中大家用的最多的應(yīng)該就是...
作者:Charon審稿:童蒙編輯:amethyst 眾所周知,三代測序的單堿基測序錯誤率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于二代測序,PB的單堿基錯誤率有10-15%,而ONT也有5-20%[1],那么...
ABBA-BABA分析方法最早發(fā)布于2012年NATURE的文章:Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
三代Pacbio和Nanopore測序技術(shù)的快速發(fā)展推動了比較基因組學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)步,泛基因組構(gòu)建和結(jié)構(gòu)變異識別成為該領(lǐng)域研究前沿。其中,共線性分析是比較基因組學(xué)的重要組成部分,...
Assembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred ...
1. ncRNA 非編碼RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等不編碼蛋白質(zhì)的RNA,它...