對于所有數(shù)據(jù)類型，”文庫拆分”涉及從一端或雙端短序列中識別和移除細(xì)胞條形碼序列 (cell barcode)和UMI。如果提前知道加入的細(xì)胞條形碼，比如數(shù)據(jù)來自基于PCR板的...
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單細(xì)胞分析---測序文庫拆分 (Demultiplexing) -
StatQuest-PCA學(xué)習(xí)劉小澤寫于19.4.27聚類分析的基礎(chǔ)就是PCA，掌握這個對以后那么這次就先跟著statquest來學(xué)習(xí)一下，視頻鏈接在https://www.youtube.com/wat...
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Day 11 充分理解GSVA和GSEA單個基因集的GSEA分析 http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/index.jsp GSEA官網(wǎng)列出關(guān)于msigdb基...
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TWAS（fusion）最近在看遺傳數(shù)據(jù)與表達(dá)結(jié)合的東西，介紹一個經(jīng)典的方法吧，fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
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有相關(guān)性就有因果關(guān)系嗎，教你玩轉(zhuǎn)孟德爾隨機(jī)化分析（mendelian randomization ）
流行病學(xué)研究常見的分析就是相關(guān)性分析了。 相關(guān)性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路，比如缺乏元素A與某種癌癥相關(guān)，那么我們可以通過補(bǔ)充元素A來減少患癌率。這個結(jié)論的大前...
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【記筆記】《身心合一的奇跡力量》
兩年前看《輕而易舉的富足》，知道了真我和假我，但也只是知道有這么一個概念而已。 活在當(dāng)下，一直是個很流行的詞兒，可到底如何才算是活在當(dāng)下呢？ 大家有看過《正念的奇跡》嗎？吃飯...
