這篇筆記是幾個視頻內(nèi)容的綜合,每個視頻里我只選取了幾張PPT。主講人舉例了一篇已經(jīng)發(fā)表的文章來進(jìn)行具體的流程分析。這篇文章里的外顯子數(shù)據(jù)分析基本是一個比較標(biāo)準(zhǔn)的流程。樣品是來...
這篇筆記是幾個視頻內(nèi)容的綜合,每個視頻里我只選取了幾張PPT。主講人舉例了一篇已經(jīng)發(fā)表的文章來進(jìn)行具體的流程分析。這篇文章里的外顯子數(shù)據(jù)分析基本是一個比較標(biāo)準(zhǔn)的流程。樣品是來...
清明節(jié)了,放假期間好好放松一下自己,但是我仍然記得大學(xué)老師說過的一句話,放假休息的同時,總結(jié)過去,展望以后,所以說假期是一個承前啟后的時間段,今天我們不講新的東西,而是回顧一...
Tyler W. Rinker & Dason Kurkiewicz翻譯:詩翔 pacman包是一個整合了基礎(chǔ)包library相關(guān)函數(shù)的包,用于更方便地對R包進(jìn)行管理。該包可...
??上一篇記錄了mapping這一步的軟件選擇,也講到了對于sam文件如何考慮MAPQ的過濾,這篇我主要想記錄一下bam文件在進(jìn)行call variation之前的處理。??...
??最近一直忙期末匯報和腳本編寫,沒來的及接著往下寫文章,年前把這一塊寫了,然后再往下的分析流程就比較特異性了,做一步寫一步那種,相對于這種已經(jīng)常規(guī)化的流程(除了一些細(xì)節(jié)上的...
使用samtools 1.10 發(fā)現(xiàn)不能生成vcf了 samtools mpileup bcftools call 中有 -c -m 參數(shù) 理解是 -c 用來call...
最近在學(xué)單細(xì)胞測序,學(xué)習(xí)了B站生信技能書樹的單細(xì)胞教程,https://www.bilibili.com/video/BV1dt411Y7nn[https://www.bil...