測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
發(fā)簡信
IP屬地：北京
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換） -
閑云野鶴邢岫煙——紅學(xué)家為什么評她是"書中第一流人物"?邢岫煙，在群星璀璨的大觀園中，她似乎是最不起眼的一個。 她出身寒微，才華也不算出眾，但是作者卻給她取了一個非常有詩意的名字——岫煙。 讓人忍不住想起“云無心以出岫，鳥倦飛而知...
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利用PYTHON爬取上市公司年報并生成財務(wù)分析
因為小編是一個比較懶的人，所以有時候就想能不能通過一些方式提高日常工作中那些定時定點(diǎn)需要做的工作，于是在閑暇時間抱著聯(lián)系python的目的寫下了這段關(guān)于財務(wù)分析的代碼，感謝去...
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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用RStudio制作簡歷最簡單的辦法很早的時候，我給自己做過一個個人簡歷[swcyo.gitee.io/cv]的網(wǎng)站并上傳到Github上了，但是由于Github很不穩(wěn)定，所以我又導(dǎo)到碼云上，不得不說碼云確實很...
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寶藏R包tinyarray：常用圖表一鍵收走最近抽空整理了以前寫的函數(shù)，規(guī)范tinyarray包，反復(fù)檢查和優(yōu)化，調(diào)整了好久，終于得到下面的check結(jié)果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈，沒有那么快)整理了...
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查找基因的啟動子、UTR、TSS等區(qū)域以及預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)
基礎(chǔ)知識 首先我們了解一些基礎(chǔ)知識（注：文中圖片皆可點(diǎn)擊放大查看！）： 啟動子（promoter）：與RNA聚合酶結(jié)合并能起始mRNA合成的序列。轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)（TSS）：轉(zhuǎn)錄時...
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學(xué)分析寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時候感覺是浪費(fèi)時間，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識，不斷記錄反思，也...
